当前蛋白身份：Q6Q1S2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2IEQ Core Structure of S2 from the Human Coronavirus NL63 Spike Glycoprotein 提交 2006-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
981–1037（57 aa）
片段：residues 981-1038, 1242-1283 connected by 10-mer link
链 A
1242–1283（42 aa）
片段：residues 981-1038, 1242-1283 connected by 10-mer link
链 B
981–1037（57 aa）
片段：residues 981-1038, 1242-1283 connected by 10-mer link
链 B
1242–1283（42 aa）
片段：residues 981-1038, 1242-1283 connected by 10-mer link
链 C
981–1037（57 aa）
片段：residues 981-1038, 1242-1283 connected by 10-mer link
链 C
1242–1283（42 aa）
片段：residues 981-1038, 1242-1283 connected by 10-mer link
|
未记录 | NA SODIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；PEG 400, sodium acetate, Imidazole, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.240 |
| 3KBH Crystal structure of NL63 respiratory coronavirus receptor-binding domain complexed with its human receptor 提交 2009-10-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
481–616（136 aa）
片段：residues 481-616
链 G
481–616（136 aa）
片段：residues 481-616
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；285 K；20% PEG 6000, 100 mM Na citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 285K
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.300 |
| 3KBH Crystal structure of NL63 respiratory coronavirus receptor-binding domain complexed with its human receptor 提交 2009-10-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
481–616（136 aa）
片段：residues 481-616
链 H
481–616（136 aa）
片段：residues 481-616
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；285 K；20% PEG 6000, 100 mM Na citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 285K
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.300 |
| 5SZS Glycan shield and epitope masking of a coronavirus spike protein observed by cryo-electron microscopy 提交 2016-08-15 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
16–1291（1276 aa）
链 B
16–1291（1276 aa）
链 C
16–1291（1276 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7FC3 structure of NL63 receptor-binding domain complexed with horse ACE2 提交 2021-07-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
481–611（131 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；1.8M Ammonium sulfate, 0.1M BIS-TRIS pH6.5, 2% v/v polyethylene glycol monomethylether 550
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.283 |
| 7KIP A 3.4 Angstrom cryo-EM structure of the human coronavirus spike trimer computationally derived from vitrified NL63 virus particles 提交 2020-10-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1356（1356 aa）
链 B
1–1356（1356 aa）
链 C
1–1356（1356 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris, pH 8.0, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 8FR7 A hinge glycan regulates spike bending and impacts coronavirus infectivity 提交 2023-01-06 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1356（1356 aa）
链 B
1–1356（1356 aa）
链 C
1–1356（1356 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris, pH 8.0, 120 mM NaCl, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9OPQ TMPRSS2 (S441A) bound to the HCoV-NL63 S2'region genetically fused to the HCoV-HKU1 RBD 提交 2025-05-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
867–877（11 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |
| 9Z3J HCoV-NL63 S2' peptide bound to TMPRSS2 S441A (complexed with the H1H7 Fab and an anti-kappa-nanobody) 提交 2025-11-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
866–880（15 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å |