当前蛋白身份：Q6Q547
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Y2Y Structural Characterization of Nop10p using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy 提交 2004-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–58（58 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）110 mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.5 mM 15N/13C Nop1p0p; 10 mM potassium phosphate buffer, pH 6.5; 100 mM potassium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5 mM 15N/13C Nop1p0p; 10 mM potassium phosphate buffer, pH 6.5; 100 mM potassium chloride; 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2AQA NMR structural analysis of Nop10p from Saccharomyces cerevisiae 提交 2005-08-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–58（57 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM; 100mM；压力 1
NMR样品组成
1mM yNop10p unlabelled; Sodium Acetate, KCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM yNop10p unlabelled; Sodium Acetate, KCl | 100% D2O
NMR样品组成
1mM yNop10p 15N-labelled; Sodium Acetate, KCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM yNop10p 15N,13C-labelled; Sodium Acetate, KCl | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3U28 Crystal structure of a Cbf5-Nop10-Gar1 complex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2011-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–58（58 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.04；293 K；0.2M sodium malonate, 7%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.04, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.233 |
| 3UAI Structure of the Shq1-Cbf5-Nop10-Gar1 complex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2011-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–58（58 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；297 K；0.1M Bis-Tris, 20%(w/v) polyethylene glycol monomethyl ether 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
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分辨率 3.06 Å R-free 0.275 |
| 9G25 snR30 snoRNP - State 1 - Utp23-Krr1-deltaC3 提交 2024-07-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–58（58 aa）
链 F
1–58（58 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.89 Å |
| 9G28 snR30 snoRNP - State 2 - Utp23-Krr1-deltaC3 提交 2024-07-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–58（58 aa）
链 F
1–58（58 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.18 Å |