当前蛋白身份:Q73QH2 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
10QF Crystal Structure of Treponema denticola Sialidase (TDE_0471) 提交 2026-02-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–543(519 aa)
未记录 CD CADMIUM ION × 14 NA SODIUM ION × 2 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;296 K;25 mM Citric acid, 75 mM Bis-tris propane, pH 7.4, 20 mM Cadmium chloride, 25% PEG400, seeded
分辨率 1.63 Å R-free 0.187
10QG Crystal Structure of Treponema denticola Sialidase (TDE_0471) bound to Neu5Ac2en (DANA) 提交 2026-02-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–543(519 aa)
未记录 DAN 2-DEOXY-2,3-DEHYDRO-N-ACETYL-NEURAMINIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CD CADMIUM ION × 23 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.8;296 K;100 mM HEPES, pH 7.8, 20 mM Cadmium chloride, 25% PEG400, soak in mother liquor with 25 mM DANA for 20 min
分辨率 1.55 Å R-free 0.153
10QH Crystal Structure of Treponema denticola Sialidase (TDE_0471) Bound to Neu5Ac (NANA) 提交 2026-02-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–543(519 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CD CADMIUM ION × 17 SLB N-acetyl-beta-neuraminic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;296 K;100 mM Tris, pH 8.2, 20 mM Cadmium chloride, 25% PEG400, soak in mother liquor with 15 mM Neu5Ac
分辨率 1.56 Å R-free 0.158
10QI Crystal Structure of Treponema denticola Sialidase (TDE_0471) D165A mutant bound to 3'-sialyllactose (only Neu5Ac visible) 提交 2026-02-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–543(519 aa)
突变:D165A SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1 GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CD CADMIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;296 K;100 mM Bis-tris, pH 6.5, 20 mM Cadmium chliride, 23% PEG400, 5 mM 3'-sialyllactose
分辨率 1.81 Å R-free 0.190