当前蛋白身份:Q76PP8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
11BC Human Nap1 in complex with HIV-1 Rev 提交 2026-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–116(116 aa)
链 D 1–116(116 aa)
链 E 1–116(116 aa)
链 F 1–116(116 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
11BE HIV-1 Rev Filament 提交 2026-02-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 155 PDB 声明:155-meric(155) 与蛋白数一致
链 A1 1–116(116 aa)
链 A4 1–116(116 aa)
链 A5 1–116(116 aa)
链 A9 1–116(116 aa)
链 B1 1–116(116 aa)
链 B4 1–116(116 aa)
链 B5 1–116(116 aa)
链 B9 1–116(116 aa)
链 C1 1–116(116 aa)
链 C5 1–116(116 aa)
链 C6 1–116(116 aa)
链 C9 1–116(116 aa)
链 D1 1–116(116 aa)
链 D5 1–116(116 aa)
链 D6 1–116(116 aa)
链 D9 1–116(116 aa)
链 E1 1–116(116 aa)
链 E5 1–116(116 aa)
链 E6 1–116(116 aa)
链 E9 1–116(116 aa)
链 F1 1–116(116 aa)
链 F5 1–116(116 aa)
链 F6 1–116(116 aa)
链 F9 1–116(116 aa)
链 G1 1–116(116 aa)
链 G5 1–116(116 aa)
链 G6 1–116(116 aa)
链 G9 1–116(116 aa)
链 H1 1–116(116 aa)
链 H5 1–116(116 aa)
链 H6 1–116(116 aa)
链 H9 1–116(116 aa)
链 I1 1–116(116 aa)
链 I4 1–116(116 aa)
链 I9 1–116(116 aa)
链 J1 1–116(116 aa)
链 J4 1–116(116 aa)
链 J9 1–116(116 aa)
链 K1 1–116(116 aa)
链 K4 1–116(116 aa)
链 K9 1–116(116 aa)
链 L1 1–116(116 aa)
链 L4 1–116(116 aa)
链 L9 1–116(116 aa)
链 M1 1–116(116 aa)
链 M4 1–116(116 aa)
链 M5 1–116(116 aa)
链 M9 1–116(116 aa)
链 N1 1–116(116 aa)
链 N4 1–116(116 aa)
链 N5 1–116(116 aa)
链 N9 1–116(116 aa)
链 O1 1–116(116 aa)
链 O4 1–116(116 aa)
链 O5 1–116(116 aa)
链 O9 1–116(116 aa)
链 P1 1–116(116 aa)
链 P5 1–116(116 aa)
链 P9 1–116(116 aa)
链 R1 1–116(116 aa)
链 R4 1–116(116 aa)
链 R9 1–116(116 aa)
链 S1 1–116(116 aa)
链 S4 1–116(116 aa)
链 S9 1–116(116 aa)
链 T1 1–116(116 aa)
链 T4 1–116(116 aa)
链 T5 1–116(116 aa)
链 T9 1–116(116 aa)
链 U1 1–116(116 aa)
链 U4 1–116(116 aa)
链 U5 1–116(116 aa)
链 U9 1–116(116 aa)
链 V1 1–116(116 aa)
链 V5 1–116(116 aa)
链 V6 1–116(116 aa)
链 V9 1–116(116 aa)
链 W1 1–116(116 aa)
链 W5 1–116(116 aa)
链 W6 1–116(116 aa)
链 W9 1–116(116 aa)
链 X1 1–116(116 aa)
链 X5 1–116(116 aa)
链 X6 1–116(116 aa)
链 X9 1–116(116 aa)
链 Y1 1–116(116 aa)
链 Y5 1–116(116 aa)
链 Y6 1–116(116 aa)
链 Y9 1–116(116 aa)
链 a3 1–116(116 aa)
链 a7 1–116(116 aa)
链 a8 1–116(116 aa)
链 b3 1–116(116 aa)
链 b7 1–116(116 aa)
链 b8 1–116(116 aa)
链 c2 1–116(116 aa)
链 c7 1–116(116 aa)
链 c8 1–116(116 aa)
链 d2 1–116(116 aa)
链 d7 1–116(116 aa)
链 d8 1–116(116 aa)
链 e2 1–116(116 aa)
链 e7 1–116(116 aa)
链 e8 1–116(116 aa)
链 f2 1–116(116 aa)
链 f7 1–116(116 aa)
链 f8 1–116(116 aa)
链 g2 1–116(116 aa)
链 g7 1–116(116 aa)
链 g8 1–116(116 aa)
链 h2 1–116(116 aa)
链 h7 1–116(116 aa)
链 h8 1–116(116 aa)
链 i3 1–116(116 aa)
链 i7 1–116(116 aa)
链 j3 1–116(116 aa)
链 j7 1–116(116 aa)
链 k3 1–116(116 aa)
链 k7 1–116(116 aa)
链 l3 1–116(116 aa)
链 l7 1–116(116 aa)
链 m3 1–116(116 aa)
链 m7 1–116(116 aa)
链 m8 1–116(116 aa)
链 n3 1–116(116 aa)
链 n7 1–116(116 aa)
链 n8 1–116(116 aa)
链 o3 1–116(116 aa)
链 o7 1–116(116 aa)
链 o8 1–116(116 aa)
链 p3 1–116(116 aa)
链 p7 1–116(116 aa)
链 p8 1–116(116 aa)
链 r3 1–116(116 aa)
链 r7 1–116(116 aa)
链 s3 1–116(116 aa)
链 s7 1–116(116 aa)
链 t3 1–116(116 aa)
链 t7 1–116(116 aa)
链 t8 1–116(116 aa)
链 u3 1–116(116 aa)
链 u7 1–116(116 aa)
链 u8 1–116(116 aa)
链 v2 1–116(116 aa)
链 v7 1–116(116 aa)
链 v8 1–116(116 aa)
链 w2 1–116(116 aa)
链 w7 1–116(116 aa)
链 w8 1–116(116 aa)
链 x2 1–116(116 aa)
链 x7 1–116(116 aa)
链 x8 1–116(116 aa)
链 y2 1–116(116 aa)
链 y7 1–116(116 aa)
链 y8 1–116(116 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.30 Å
5DHV HIV-1 Rev NTD dimers with variable crossing angles 提交 2015-08-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 N 1–65(65 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Crystals of scFv-Rev were initially grown in 20% PEG 3350, a variety of salts (200 mM sodium sulfate, sodium bromide, or ammonium phosphate dibasic), and pH ranging from 6.5-8.5.
分辨率 2.30 Å R-free 0.227
5DHV HIV-1 Rev NTD dimers with variable crossing angles 提交 2015-08-31 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 M 1–65(65 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Crystals of scFv-Rev were initially grown in 20% PEG 3350, a variety of salts (200 mM sodium sulfate, sodium bromide, or ammonium phosphate dibasic), and pH ranging from 6.5-8.5.
分辨率 2.30 Å R-free 0.227
5DHY HIV-1 Rev NTD dimers with variable crossing angles 提交 2015-08-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–65(65 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Crystals of scFv-Rev were initially grown in 20% PEG 3350, a variety of salts (200 mM sodium sulfate, sodium bromide, or ammonium phosphate dibasic), and pH ranging from 6.5-8.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.300
5DHY HIV-1 Rev NTD dimers with variable crossing angles 提交 2015-08-31 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 M 1–65(65 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Crystals of scFv-Rev were initially grown in 20% PEG 3350, a variety of salts (200 mM sodium sulfate, sodium bromide, or ammonium phosphate dibasic), and pH ranging from 6.5-8.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.300
5DHZ HIV-1 Rev NTD dimers with variable crossing angles 提交 2015-08-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 M 1–65(65 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Crystals of scFv-Rev were initially grown in 20% PEG 3350, a variety of salts (200 mM sodium sulfate, sodium bromide, or ammonium phosphate dibasic), and pH ranging from 6.5-8.5
分辨率 4.30 Å R-free 0.324
6BSY HIV-1 Rev assembly domain (residues 1-69) 提交 2017-12-04 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–70(70 aa) 片段:assembly domain (UNP residues 1-70)
链 B 1–70(70 aa) 片段:assembly domain (UNP residues 1-70)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;283.15 K;0.1 M sodium citrate, 25% MPD
分辨率 2.25 Å R-free 0.260
6CF2 Crystal structure of HIV-1 Rev (residues 1-93)-RNA aptamer complex 提交 2018-02-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 F 1–93(93 aa) 片段:UNP residues 1-93
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291.15 K;2% v/v 1,4-dioxane, 0.1 M Tris, pH 8.0, 15% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.241