当前蛋白身份：Q7L523
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5X6V Crystal structure of human heteroheptameric complex 提交 2017-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
183–313（131 aa）
片段：UNP RESIDUES 183-313
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.243 |
| 6CES Cryo-EM structure of GATOR1-RAG 提交 2018-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–313（313 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6EHR The crystal structure of the human LAMTOR-RagA CTD-RagC CTD complex 提交 2017-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
183–313（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% [w/v] PEG 4000, 0.1M tri-sodium-citrate pH5.5, 5% [v/v] isopropanol
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.263 |
| 6NZD Cryo-EM Structure of the Lysosomal Folliculin Complex (FLCN-FNIP2-RagA-RagC-Ragulator) 提交 2019-02-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 F
1–313（313 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Whatman 597
|
分辨率 3.60 Å |
| 6S6A Crystal structure of RagA-Q66L/RagC-T90N GTPase heterodimer complex 提交 2019-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–313（313 aa）
|
突变：Q66L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 9JE pentane-1,5-diol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MOPSO, Bis-Tris pH 6.5, 40mM polyamines ( mixture of spermine tetrahydrochloride, spermidine trihydrochloride, 1,4. diaminobutane dihydrochloride, 0.1 M D/L-ornithine monohydrochloride), 10% (w/v) PEG 8000. 20% (v/v) 1,5 - Pentanediol and 24 % (v/v) glycerol.
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.275 |
| 6S6A Crystal structure of RagA-Q66L/RagC-T90N GTPase heterodimer complex 提交 2019-07-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–313（313 aa）
|
突变：Q66L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 9JE pentane-1,5-diol × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MOPSO, Bis-Tris pH 6.5, 40mM polyamines ( mixture of spermine tetrahydrochloride, spermidine trihydrochloride, 1,4. diaminobutane dihydrochloride, 0.1 M D/L-ornithine monohydrochloride), 10% (w/v) PEG 8000. 20% (v/v) 1,5 - Pentanediol and 24 % (v/v) glycerol.
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.275 |
| 6S6D Crystal structure of RagA-Q66L-GTP/RagC-S75N-GDP GTPase heterodimer complex 提交 2019-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–313（313 aa）
|
突变：Q66L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100mM MOPSO, Bis-Tris pH 6.5, 40mM polyamines ( mixture of spermine
tetrahydrochloride, spermidine trihydrochloride, 1,4. diaminobutane dihydrochloride,
0.1 M D/L-ornithine monohydrochloride), 10% (w/v) PEG 8000. 20% (v/v) 1,5 -
Pentanediol and 24 % (v/v) glycerol.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.287 |
| 6S6D Crystal structure of RagA-Q66L-GTP/RagC-S75N-GDP GTPase heterodimer complex 提交 2019-07-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–313（313 aa）
|
突变：Q66L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 9JE pentane-1,5-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100mM MOPSO, Bis-Tris pH 6.5, 40mM polyamines ( mixture of spermine
tetrahydrochloride, spermidine trihydrochloride, 1,4. diaminobutane dihydrochloride,
0.1 M D/L-ornithine monohydrochloride), 10% (w/v) PEG 8000. 20% (v/v) 1,5 -
Pentanediol and 24 % (v/v) glycerol.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.287 |
| 6SB0 cryo-EM structure of mTORC1 bound to PRAS40-fused active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
1–313（313 aa）
链 I
1–313（313 aa）
|
突变：Q66L 突变：Q66L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；50mM HEPES pH 7.0, 100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 6SB2 cryo-EM structure of mTORC1 bound to active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 C
1–313（313 aa）
链 I
1–313（313 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；100mM Tris-HCl pH7.0, 260mM NaCl, 5mM MgCl2, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.20 Å |
| 6U62 Raptor-Rag-Ragulator complex 提交 2019-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–313（313 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 6ULG Cryo-EM structure of the FLCN-FNIP2-Rag-Ragulator complex 提交 2019-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 F
1–313（313 aa）
|
突变：T21N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 6WJ2 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the pre-GAP state 提交 2020-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 F
1–313（313 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6WJ3 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the post-GAP state 提交 2020-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 F
1–313（313 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 U3J xanthosine diphosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7T3A GATOR1-RAG-RAGULATOR - Inhibitory Complex 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 K
1–313（313 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7T3B GATOR1-RAG-RAGULATOR - GAP Complex 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 D
1–313（313 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7T3C GATOR1-RAG-RAGULATOR - Dual Complex 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 D
1–313（313 aa）
链 K
1–313（313 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7UX2 cryo-EM structure of the Raptor-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–313（313 aa）
链 I
1–313（313 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 D
1–313（313 aa）
链 K
1–313（313 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 F
1–313（313 aa）
链 M
1–313（313 aa）
链 V
1–313（313 aa）
链 c
1–313（313 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 B
1–313（313 aa）
|
未记录 | CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 D
1–313（313 aa）
链 P
1–313（313 aa）
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未记录 | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–313（313 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |