当前蛋白身份：Q7NY09
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8HTC Crystal structure of a SeMet-labeled effector from Chromobacterium violaceum in complex with Ubiquitin 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
45–276（232 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；289 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.25, 200 mM sodium acetate, 22% PEG 8000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 8HTD Crystal structure of an effector from Chromobacterium violaceum in complex with ubiquitin 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
45–276（232 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 200 mM sodium acetate, 28% to 30% PEG 8000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8HTE Crystal structure of an effector mutant in complex with ubiquitin 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
45–276（232 aa）
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突变：E220A | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 NCA NICOTINAMIDE × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；100 mM BIS-TRIS propane, pH 7.0, and 1.5 M ammonium sulfate
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分辨率 2.31 Å R-free 0.228 |
| 8HTF Crystal structure of an effector in complex with ubiquitin 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
45–276（232 aa）
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未记录 | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；289 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.25, 200 mM sodium acetate, 22% PEG 8000, 25% glycerol
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分辨率 2.15 Å R-free 0.223 |
| 8UX2 Chromobacterium violaceum mono-ADP-ribosyltransferase CteC in complex with NAD+ 提交 2023-11-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–276（241 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.25M calcium acetate, 20% PEG 3000
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.227 |
| 8UX2 Chromobacterium violaceum mono-ADP-ribosyltransferase CteC in complex with NAD+ 提交 2023-11-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–276（241 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.25M calcium acetate, 20% PEG 3000
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.227 |
| 8UX2 Chromobacterium violaceum mono-ADP-ribosyltransferase CteC in complex with NAD+ 提交 2023-11-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
36–276（241 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.25M calcium acetate, 20% PEG 3000
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.227 |