当前蛋白身份：Q7Z3L0
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6PAI Structure of the human DDB1-DDA1-DCAF15 E3 ubiquitin ligase bound to RBM39 and sulfonamide E7820 提交 2019-06-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
78–174（97 aa）
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 O6M 3-cyano-N-(3-cyano-4-methyl-1H-indol-7-yl)benzene-1-sulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M sodium HEPES, pH 7.0, 15% w/v PEG4000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.252 |
| 6SJ7 Structure of the human DDB1-DDA1-DCAF15 E3 ubiquitin ligase bound to RBM39 and Indisulam 提交 2019-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
91–171（81 aa）
|
未记录 | EF6 N~1~-(3-chloro-1H-indol-7-yl)benzene-1,4-disulfonamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 6UD7 Crystal structure of full-length human DCAF15-DDB1(deltaBPB)-DDA1-RBM39 in complex with indisulam 提交 2019-09-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
91–171（81 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 EF6 N~1~-(3-chloro-1H-indol-7-yl)benzene-1,4-disulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2% (v:v) TacsimateTM, pH 5.0, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, and 10-20% (w:v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 6UE5 Crystal structure of full-length human DCAF15-DDB1-deltaPBP-DDA1-RBM39 in complex with 4-(aminomethyl)-N-(3-cyano-4-methyl-1H-indol-7-yl)benzenesulfonamide 提交 2019-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
91–171（81 aa）
|
未记录 | Q5J 4-(aminomethyl)-N-(3-cyano-4-methyl-1H-indol-7-yl)benzene-1-sulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291.5 K；2% (v:v) TacsimateTM, pH 5.0, 0.1 M sodium citrate tribasic
676 dihydrate, pH 5.6, and 10-20% (w:v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.266 |