当前蛋白身份：Q7Z3Y4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1L7I Crystal Structure of the anti-ErbB2 Fab2C4 提交 2002-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
23–236（214 aa）
片段：light chain (residues 1-214)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；35%-45% saturated (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 5VL7 PCSK9 complex with Fab33 提交 2017-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 L
127–236（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；potassium sodium phosphate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.245 |
| 5VR9 CH1/Ckappa Fab based on Matuzumab 提交 2017-05-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
130–235（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；see publication for details
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.244 |
| 5VR9 CH1/Ckappa Fab based on Matuzumab 提交 2017-05-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
130–235（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；see publication for details
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.244 |
| 5VSI CH1/Ckappa Fab mutant 15.1 提交 2017-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
130–235（106 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；see publication
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分辨率 1.51 Å R-free 0.227 |
| 6BGT Structure of Trastuzumab Fab mutant in complex with Her2 extracellular domain 提交 2017-10-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
127–236（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；100 mM MES, pH 6.5, 18% PEG3350, 10% glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 6MH2 Structure of Herceptin Fab without antigen 提交 2018-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
127–236（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；200 mM ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris, pH 5.5, 25% v/v PEG3350
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分辨率 2.80 Å R-free 0.306 |
| 6MH2 Structure of Herceptin Fab without antigen 提交 2018-09-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
127–236（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；200 mM ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris, pH 5.5, 25% v/v PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.306 |
| 6MXR Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98M,HC-G99M] 提交 2018-10-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
127–236（110 aa）
链 L
127–236（110 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5.6；295 K；0.1 M tris-sodium citrate, pH 5.6, 11% PEG4000, 8% isopropanol
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.200 |
| 6MXS Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98F,HC-G99M] 提交 2018-10-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
127–236（110 aa）
链 L
127–236（110 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5.6；295 K；0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 12% PEG4000, 10% isopropanol
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 6MY4 Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98M,HC-G99M,LC-S30bR] 提交 2018-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
127–236（110 aa）
链 L
127–236（110 aa）
|
突变：S30bR,S30bR 突变：S30bR,S30bR | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 8；295 K；0.05 M imidazole, pH 8.0, 18% PEG6000
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.230 |
| 6MY5 Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98F,HC-G99M,LC-S30bR] 提交 2018-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
127–236（110 aa）
链 L
127–236（110 aa）
|
突变：S30bR,S30bR 突变：S30bR,S30bR | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 8；295 K；0.04 M imidazole, pH 8.0, 21% PEG6000
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.229 |
| 6U1N GPCR-Beta arrestin structure in lipid bilayer 提交 2019-08-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 L
127–236（110 aa）
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未记录 | 2CU 3-amino-5-chloro-N-cyclopropyl-4-methyl-6-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]thieno[2,3-b]pyridine-2-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7ZLG Cryo-EM structure of C-mannosyltransferase CeDPY19, in complex with acceptor peptide and bound to CMT2-Fab and anti-Fab nanobody 提交 2022-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 L
23–236（214 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 7ZLI Cryo-EM structure of C-mannosyltransferase CeDPY19, in complex with Dol25-P-Man and bound to CMT2-Fab and anti-Fab nanobody 提交 2022-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 L
23–236（214 aa）
|
未记录 | IZY Dolichol monophosphate beta-D-Mannose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 7ZLJ Cryo-EM structure of C-mannosyltransferase CeDPY19, in ternary complex with Dol25-P-C-Man and acceptor peptide, bound to CMT2-Fab and anti-Fab nanobody 提交 2022-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 L
23–236（214 aa）
|
未记录 | IZU [(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[(3~{S},6~{E},10~{Z},14~{E})-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraenoxy]phosphinic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 9BDG Influenza A virus Hemagglutinin H3/Darwin/6/2021 in complex with Fab ADI-85647 提交 2024-04-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 G
23–236（214 aa）
链 H
23–236（214 aa）
链 I
23–236（214 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.01 Å |
| 9MY8 D7 Herpes Virus Simplex Neutralizing Nanobody Bound to HSV Glycoprotein gD 提交 2025-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 L
23–236（214 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |