当前蛋白身份:Q7Z434 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2MS7 High-resolution solid-state NMR structure of the helical signal transduction filament MAVS CARD 提交 2014-07-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 A 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 B 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 C 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 D 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 E 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 F 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 G 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 H 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 I 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 J 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 K 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 L 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 M 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 N 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 O 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 P 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 Q 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 R 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 S 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 T 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
链 U 1–100(100 aa) 片段:UNP RESIDUES 1-100
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7;278 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 ambient
NMR样品组成 20 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] MAVS CARD-1, H2O | H2O
NMR样品组成 20 mM [1-13C]-Glc U-15N MAVS CARD-2, H2O | H2O
NMR样品组成 20 mM [2-13C]-Glc U-15N MAVS CARD-3, H2O | H2O
NMR样品组成 20 mM [1/2-13C]-Glc(mixed) U15N MAVS CARD-4, H2O | H2O
NMR样品组成 20 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 1:6(Unlabeled) Diluted sample MAVS CARD-5, H2O | H2O
NMR样品组成 20 mM U15N mixed with U13C labeled sample MAVS CARD-6, H2O | H2O
分辨率未提供
2MS8 Solution NMR structure of MAVS CARD 提交 2014-07-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–100(100 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成 300 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] MAVS CARD-1, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
2VGQ Crystal Structure of Human IPS-1 CARD 提交 2007-11-15 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–93(93 aa) 片段:MMBP RESIDUES 27-392, CARD DOMAIN RESIDUES 3-93,MMBP RESIDUES 27-392, CARD DOMAIN RESIDUES 3-93
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.220
3J6C Cryo-EM structure of MAVS CARD filament 提交 2014-02-04 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 3–93(91 aa) 片段:caspase activation recruitment domain (UNP residues 3-93)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT;pH 7.5;20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III)
分辨率 9.60 Å
3J6C Cryo-EM structure of MAVS CARD filament 提交 2014-02-04 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–93(91 aa) 片段:caspase activation recruitment domain (UNP residues 3-93)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT;pH 7.5;20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III)
分辨率 9.60 Å
3J6C Cryo-EM structure of MAVS CARD filament 提交 2014-02-04 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–93(91 aa) 片段:caspase activation recruitment domain (UNP residues 3-93)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT;pH 7.5;20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III)
分辨率 9.60 Å
3J6J 3.6 Angstrom resolution MAVS filament generated from helical reconstruction 提交 2014-03-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
链 B 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
链 C 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
链 D 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
链 E 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
链 G 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
链 I 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
链 L 1–97(97 aa) 片段:N-terminal CARD domain (UNP residues 1-97)
突变:P2A 突变:P2A 突变:P2A 突变:P2A 突变:P2A 突变:P2A 突变:P2A 突变:P2A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris, 150 mM NaCl;pH 7.5;20 mM Tris, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN;Plunged in liquid nitrogen (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.64 Å R-free 0.276
4P4H Caught-in-action signaling complex of RIG-I 2CARD domain and MAVS CARD domain 提交 2014-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 I 1–99(99 aa)
链 J 1–99(99 aa)
链 K 1–99(99 aa)
链 L 1–99(99 aa)
链 M 1–99(99 aa)
链 N 1–99(99 aa)
链 O 1–99(99 aa)
链 P 1–99(99 aa)
突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;Tri-Li Citrate, PEG 3350, Cr(III) Cl3
分辨率 3.40 Å R-free 0.240
4Z8M Crystal structure of the MAVS-TRAF6 complex 提交 2015-04-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 450–468(19 aa) 片段:UNP residues 450-468
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;6% (v/v) Tacsimate pH 6.0, 0.1 M MES pH 6.0, and 25% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.95 Å R-free 0.238
4Z8M Crystal structure of the MAVS-TRAF6 complex 提交 2015-04-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 450–468(19 aa) 片段:UNP residues 450-468
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;6% (v/v) Tacsimate pH 6.0, 0.1 M MES pH 6.0, and 25% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.95 Å R-free 0.238
7DNI MDA5 CARDs-MAVS CARD polyUb complex 提交 2020-12-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 M 1–97(97 aa)
链 N 1–97(97 aa)
链 O 1–97(97 aa)
链 P 1–97(97 aa)
突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 突变:D23K, E26K, E80K 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
分辨率 3.20 Å
8WKW Structure of MAVS-CARD Filament 提交 2023-09-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 A 1–97(97 aa)
链 B 1–97(97 aa)
链 C 1–97(97 aa)
链 D 1–97(97 aa)
链 E 1–97(97 aa)
链 F 1–97(97 aa)
链 G 1–97(97 aa)
链 H 1–97(97 aa)
链 I 1–97(97 aa)
链 J 1–97(97 aa)
链 K 1–97(97 aa)
链 L 1–97(97 aa)
链 M 1–97(97 aa)
链 N 1–97(97 aa)
链 O 1–97(97 aa)
链 P 1–97(97 aa)
链 Q 1–97(97 aa)
链 R 1–97(97 aa)
链 S 1–97(97 aa)
链 T 1–97(97 aa)
链 U 1–97(97 aa)
链 V 1–97(97 aa)
链 W 1–97(97 aa)
链 X 1–97(97 aa)
链 Y 1–97(97 aa)
链 Z 1–97(97 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å