当前蛋白身份：Q86U70
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2XJY Crystal structure of the LMO2:LDB1-LID complex, P21 crystal form 提交 2010-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
334–368（35 aa）
片段：RESIDUES 334-368
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4；25% PEG 1500 AND 100 MM SPG, BUFFER PH 4.0
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分辨率 2.40 Å R-free 0.229 |
| 2XJZ Crystal structure of the LMO2:LDB1-LID complex, C2 crystal form 提交 2010-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
334–368（35 aa）
片段：RESIDUES 334-368
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；1.6 M NACL, 100 MM MES PH5 AND 1 MM DTT
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分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2XJZ Crystal structure of the LMO2:LDB1-LID complex, C2 crystal form 提交 2010-07-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
334–368（35 aa）
片段：RESIDUES 334-368
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；1.6 M NACL, 100 MM MES PH5 AND 1 MM DTT
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2XJZ Crystal structure of the LMO2:LDB1-LID complex, C2 crystal form 提交 2010-07-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
334–368（35 aa）
片段：RESIDUES 334-368
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；1.6 M NACL, 100 MM MES PH5 AND 1 MM DTT
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2XJZ Crystal structure of the LMO2:LDB1-LID complex, C2 crystal form 提交 2010-07-06 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
334–368（35 aa）
片段：RESIDUES 334-368
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；1.6 M NACL, 100 MM MES PH5 AND 1 MM DTT
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2XJZ Crystal structure of the LMO2:LDB1-LID complex, C2 crystal form 提交 2010-07-06 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
334–368（35 aa）
片段：RESIDUES 334-368
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；1.6 M NACL, 100 MM MES PH5 AND 1 MM DTT
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2YPA Structure of the SCL:E47:LMO2:LDB1 complex bound to DNA 提交 2012-10-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 D
336–375（40 aa）
片段：LID, RESIDUES 336-375
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；5 % (V/V) 2-METHYL-2, 4-PENTANEDIOL (MPD), 40 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 50 MM SODIUM CACODYLATE PH 6.0 AND 2MM GLUTATHIONE
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.269 |
| 6TYD Structure of human LDB1 in complex with SSBP2 提交 2019-08-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 V
20–249（230 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；100 mM lithium sulfate monohydrate, 100 mM sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1% v/v PEG400, 10mM DTT
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分辨率 2.80 Å R-free 0.281 |
| 7OB5 Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with LDB1 phosphopeptide 提交 2021-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
401–411（11 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.1, 28% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.171 |
| 7OB8 Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with LDB1 phosphopeptide and stabilizer Fusicoccin-A 提交 2021-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
401–411（11 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FSC FUSICOCCIN × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.1, 28%PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.199 |
| 8HIB The crystal structure of Pygo2-LDB1-SSBP2 triple complex 提交 2022-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 V
20–249（230 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM Li2SO4, 100 mM sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1% v/v PEG400, and 10 mM DTT
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分辨率 2.45 Å R-free 0.246 |
| 8SSU ZnFs 3-11 of CCCTC-binding factor (CTCF) Complexed with 19mer DNA 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
195–258（64 aa）
片段：Zinc finger domains 3-11 of CTCF, Residues 195-258 of LDB1
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.04 M Citric acid,
0.06 M BIS-TRIS propane/pH 6.4,
20% w/v Polyethylene glycol 3,350
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分辨率 2.89 Å R-free 0.240 |
| 9F5B Identification of zinc ions in LMO4. 提交 2024-04-28 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
336–375（40 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.25 M Sodium Malonate pH 7, 20 % v/w PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |