当前蛋白身份：Q86XP3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7EVN The cryo-EM structure of the DDX42-SF3b complex 提交 2021-05-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–938（938 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.60 Å |
| 8DPE Crystal structure of ATP-dependent RNA helicase DDX42 提交 2022-07-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
211–646（436 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；1 uL 8 mg/mL DDX42 (in 25 mM Tris, pH 7.5, 300 mM sodium chloride, 1 mM TCEP) + 1 uL reservoir solution (6-10% PEG8000, 0.1 M Tris, pH 8.5-9.0)
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分辨率 1.53 Å R-free 0.255 |
| 8HK1 The cryo-EM structure of human pre-17S U2 snRNP 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–938（938 aa）
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未记录 | 9B0 [(2~{S},3~{S},4~{E},6~{S},7~{R},10~{R})-3,7-dimethyl-2-[(2~{E},4~{E},6~{R})-6-methyl-6-oxidanyl-7-[(2~{R},3~{R})-3-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanylpentan-2-yl]oxiran-2-yl]hepta-2,4-dien-2-yl]-7,10-bis(oxidanyl)-12-oxidanylidene-1-oxacyclododec-4-en-6-yl] 4-cycloheptylpiperazine-1-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |