当前蛋白身份：Q8IXH6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7YO9 Crystal structure of fusion protein of human TP53INP2 LIR and human GABARAP 提交 2022-08-01 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
26–40（15 aa）
片段：Tumor protein p53-inducible nuclear protein 2(1-15), Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein(16-131)
|
突变：F18S,V19T | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293 K；10% 2-propanol, 0.1 M sodium phosphate/citric acid pH 4.2, 0.2 M lithium sulfate
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分辨率 1.75 Å R-free 0.216 |
| 8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
31–43（13 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol
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分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
31–43（13 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
31–43（13 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
31–43（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol
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分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 8T31 Crystal structure of GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
31–43（13 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 8T33 Crystal structure of K46 acetylated GABARAP in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
31–43（13 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10 % w/v PEG 3000, 0.2 M Zinc acetate dihydrate, 0.1 M Sodium acetate PH 4.5
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分辨率 1.60 Å R-free 0.212 |
| 8T35 Crystal structure of K51 acetylated LC3A in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–39（10 aa）
链 B
30–39（10 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG4000, 0.1M Na-citrate pH 5.5
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分辨率 1.90 Å R-free 0.259 |
| 8T36 Crystal structure of K49 acetylated LC3A in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–39（11 aa）
片段：;GS is the remain of the removed expression tag. TP53INP2 Q8IXH6 peptide is fused to the N- terminal of the Q9H492 to facilitate the crystallization.
;
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG3350, 0.1M Na-citrate, 5% isopropanol, 0.1 M HEPES pH 7.5
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分辨率 1.85 Å R-free 0.258 |
| 8T4T Crystal structure of LC3A in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–39（11 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12.5% PEG3350, 0.2M NH4-citrate, 5% isopropanol, 0.1M MES pH6.5
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分辨率 2.36 Å R-free 0.272 |
| 8T4T Crystal structure of LC3A in complex with the LIR of TP53INP2/DOR 提交 2023-06-10 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
29–39（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12.5% PEG3350, 0.2M NH4-citrate, 5% isopropanol, 0.1M MES pH6.5
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.272 |