当前蛋白身份：Q8NB16
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2MSV Solution structure of the MLKL N-terminal domain 提交 2014-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–154（154 aa）
片段：N-terminal domain, residues 1-154
|
突变：M1L | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.12；压力 ambient
NMR样品组成
1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 20 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 2 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.5 mM [U-99% 15N] protein, 20 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 2 mM TCEP, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4M67 Crystal structure of the human MLKL kinase-like domain 提交 2013-08-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
179–471（293 aa）
片段：UNP residues 179-471
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES, 13% PEG 6000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.225 |
| 4MWI Crystal structure of the human MLKL pseudokinase domain 提交 2013-09-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
183–471（289 aa）
片段：unp residues 183-471
|
未记录 | PXN (2S)-1-[3-{[(2R)-2-hydroxypropyl]oxy}-2,2-bis({[(2R)-2-hydroxypropyl]oxy}methyl)propoxy]propan-2-ol × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% w/v pentaerythitol propoxylate, 0.1M Tris chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.194 |
| 5KNJ Pseudokinase Domain of MLKL bound to Compound 1. 提交 2016-06-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
191–471（281 aa）
片段：UNP residues 191-471
|
未记录 | 6UX 1-[4-[methyl-[2-[(3-sulfamoylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]-3-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Na Citrate and 15% PEG3350
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.256 |
| 5KNJ Pseudokinase Domain of MLKL bound to Compound 1. 提交 2016-06-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
191–471（281 aa）
片段：UNP residues 191-471
|
未记录 | 6UX 1-[4-[methyl-[2-[(3-sulfamoylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]-3-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Na Citrate and 15% PEG3350
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.256 |
| 5KO1 Pseudokinase Domain of MLKL bound to Compound 4. 提交 2016-06-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
191–471（281 aa）
片段：UNP residues 191-471
|
未记录 | 6UY [(1~{R})-2-[(4-fluorophenyl)amino]-2-oxidanylidene-1-phenyl-ethyl] 3-azanylpyrazine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M BisTRIS pH 6.5 20% PEG3350
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.226 |
| 6BWK Crystal structure of the human MLKL pseudokinase domain T357E/S358E mutant 提交 2017-12-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
190–471（282 aa）
片段：UNP Residues 190-471
|
突变：T357E S358E | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5% w/v polyethylene glycol 8000, 20% v/v polyethylene glycol 300, 0.1M Tris chloride pH 8.5, 10% v/v glycerol
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.297 |
| 6D74 Direct Activation of the Executioner Domain of MLKL by a Select Repertoire of Inositol Phosphates 提交 2018-04-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–156（156 aa）
片段：residues 1-156
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
500 uM [U-13C; U-15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6LK5 MLKL mutant - T357ES358D 提交 2019-12-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–471（471 aa）
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突变：T357E, S358D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5%(v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol,
0.1M HEPES(pH7.5),
10%(w/v) PEG 10000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.238 |
| 6LK6 MLKL mutant - T357AS358A 提交 2019-12-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
179–471（293 aa）
|
突变：T357A, S358A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14%(w/v) PEG 6000,
5% EG,
0.1M HEPES(pH7.5)
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.247 |
| 6O5Z Crystal Structure of the human MLKL pseudokinase domain bound to compound 2 提交 2019-03-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
190–471（282 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.88；293 K；0.18 M magnesium chloride, 26.8% (w/v) PEG 3350, 0.1 M sodium HEPES pH 7.88
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.232 |
| 6O5Z Crystal Structure of the human MLKL pseudokinase domain bound to compound 2 提交 2019-03-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
190–471（282 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 LN4 1-[2-fluoranyl-5-(trifluoromethyl)phenyl]-3-[4-[methyl-[2-[(3-sulfamoylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.88；293 K；0.18 M magnesium chloride, 26.8% (w/v) PEG 3350, 0.1 M sodium HEPES pH 7.88
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.232 |
| 6UX8 Structure of monobody 33 MLKL N-terminal domain complex 提交 2019-11-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
5–154（150 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG-MME 550, 0.1 M MES pH 6.5, 0.01 M Zinc acetate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.296 |
| 6ZLE Solution structure of unliganded MLKL executioner domain 提交 2020-06-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–154（153 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate,150 mM sodium chloride；压力 1
NMR测量条件
pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate,150 mM sodium chloride；压力 1
NMR样品组成
400 uM [U-13C; U-15N] MLKL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
430 uM [U-13C; U-15N] MLKL, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6ZPR Solution structure of MLKL executioner domain in complex with a covalent inhibitor 提交 2020-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–85（84 aa）
链 A
86–154（69 aa）
|
未记录 | QOK 7-(2-methoxyethoxymethyl)-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride；压力 1
NMR测量条件
pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride；压力 1
NMR样品组成
340 uM [U-13C; U-15N] MLKL, 1200 uM Compound, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
385 uM [U-13C; U-15N] MLKL, 840 uM Compound, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6ZVO Crystal structure of unliganded MLKL executioner domain 提交 2020-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–150（149 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；31 % Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, 0.15 M Potassium bromide, 0.1 M TRIS, pH 9
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.234 |
| 6ZVO Crystal structure of unliganded MLKL executioner domain 提交 2020-07-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–150（149 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；31 % Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, 0.15 M Potassium bromide, 0.1 M TRIS, pH 9
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.234 |
| 6ZVO Crystal structure of unliganded MLKL executioner domain 提交 2020-07-27 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–150（149 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 BR BROMIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；31 % Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, 0.15 M Potassium bromide, 0.1 M TRIS, pH 9
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.234 |
| 6ZZ1 Crystal structure of MLKL executioner domain in complex with a covalent inhibitor 提交 2020-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–150（149 aa）
|
未记录 | QOK 7-(2-methoxyethoxymethyl)-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；32 % Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, 0.15 M Potassium bromide, 0.1 M TRIS, pH 9
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.231 |
| 6ZZ1 Crystal structure of MLKL executioner domain in complex with a covalent inhibitor 提交 2020-08-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–150（149 aa）
|
未记录 | QOK 7-(2-methoxyethoxymethyl)-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；32 % Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, 0.15 M Potassium bromide, 0.1 M TRIS, pH 9
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.231 |
| 7JW7 Structure of monobody 27 human MLKL pseudokinase domain complex 提交 2020-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
190–471（282 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；281.15 K；0.2 M magnesium chloride, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.281 |
| 7JXU Structure of monobody 32 human MLKL pseudokinase domain complex 提交 2020-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
190–471（282 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；281.15 K；0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5, 20 % w/v PEG monomethyl ether 5000
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.240 |
| 7JXU Structure of monobody 32 human MLKL pseudokinase domain complex 提交 2020-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
190–471（282 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；281.15 K；0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5, 20 % w/v PEG monomethyl ether 5000
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.240 |
| 7MON Structure of human RIPK3-MLKL complex 提交 2021-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
190–471（282 aa）
|
未记录 | ZL1 N-[4-({2-[(cyclopropanecarbonyl)amino]pyridin-4-yl}oxy)-3-fluorophenyl]-1-(4-fluorophenyl)-2-oxo-1,2-dihydropyridine-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.2 M ammonium acetate
30%w/v PEG 4000
0.1 M trisodium citrate-citric acid pH 5.5
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.260 |
| 7NM2 Solution structure of MLKL executioner domain in complex with a fragment 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–154（153 aa）
|
未记录 | UJ5 2-[(~{S})-methoxy-(4-propan-2-ylphenyl)methyl]-3~{H}-benzimidazole-5-carboxylic acid × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 1
NMR测量条件
pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 1
NMR样品组成
430 uM [U-13C; U-15N] MLKL executioner domain, 700 uM Cpd 5, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
400 uM [U-13C; U-15N] MLKL executioner domain, 700 uM Cpd 5, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7NM4 Solution structure of MLKL executioner domain in complex with a fragment 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–154（153 aa）
|
未记录 | UJ8 (~{S})-1~{H}-benzimidazol-2-yl-(4-propan-2-ylphenyl)methanol × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 1
NMR测量条件
pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 1
NMR样品组成
385 uM [U-13C; U-15N] MLKL executioner domain, 2000 uM Cpd 3, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
315 uM [U-13C; U-15N] MLKL executioner domain, 1600 uM Cpd 3, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7NM5 Solution structure of MLKL executioner domain in complex with a fragment 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–154（153 aa）
|
未记录 | UJ2 2-[(~{S})-methoxy-(4-phenylphenyl)methyl]-3~{H}-benzimidazole-5-carboxylic acid × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 1
NMR测量条件
pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 1
NMR样品组成
400 uM [U-13C; U-15N] MLKL executioner domain, 700 uM Cpd 7, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
430 uM [U-13C; U-15N] MLKL executioner domain, 700 uM Cpd 7, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8SLZ Crystal structure of phosphorylated (T357/S358) human MLKL pseudokinase domain 提交 2023-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
190–471（282 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20%w/v PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.234 |