当前蛋白身份：Q8NHY2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5HQG WD40 domain of Human E3 Ubiquitin Ligase COP1 (RFWD2) 提交 2016-01-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
151–506（356 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium nitrate 0.5M
10% PEG 3350
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分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 5IGQ WD40 domain of Human E3 Ubiquitin Ligase COP1 (RFWD2) bound to peptide from Trib1 提交 2016-02-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
161–506（346 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 20% glycerol, 5% PEG
5000 MME
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.277 |
| 5IGQ WD40 domain of Human E3 Ubiquitin Ligase COP1 (RFWD2) bound to peptide from Trib1 提交 2016-02-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
161–506（346 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 20% glycerol, 5% PEG
5000 MME
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.277 |
| 5IGQ WD40 domain of Human E3 Ubiquitin Ligase COP1 (RFWD2) bound to peptide from Trib1 提交 2016-02-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
161–506（346 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 20% glycerol, 5% PEG
5000 MME
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.277 |
| 5IGQ WD40 domain of Human E3 Ubiquitin Ligase COP1 (RFWD2) bound to peptide from Trib1 提交 2016-02-28 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
161–506（346 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 20% glycerol, 5% PEG
5000 MME
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.277 |
| 5IGQ WD40 domain of Human E3 Ubiquitin Ligase COP1 (RFWD2) bound to peptide from Trib1 提交 2016-02-28 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
161–506（346 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 20% glycerol, 5% PEG
5000 MME
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.277 |
| 5IGQ WD40 domain of Human E3 Ubiquitin Ligase COP1 (RFWD2) bound to peptide from Trib1 提交 2016-02-28 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
161–506（346 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 20% glycerol, 5% PEG
5000 MME
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.277 |
| 9LTR Cryo-EM structure of dimeric DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1 complex 提交 2025-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–731（731 aa）
链 C
1–731（731 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9LU1 protein structure of DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2 bound to COP1 dimer 提交 2025-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–731（731 aa）
链 E
1–731（731 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 9LUL Local refinement of stacked like DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1 complex (layer 1) 提交 2025-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 H
128–731（604 aa）
链 I
128–731（604 aa）
链 K
128–731（604 aa）
链 M
128–731（604 aa）
链 N
128–731（604 aa）
链 O
128–731（604 aa）
链 W
128–731（604 aa）
链 X
128–731（604 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.99 Å |
| 9M0Y Local refinement of stacked like DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1 complex (layer 2) 提交 2025-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–731（731 aa）
链 B
1–731（731 aa）
链 C
1–731（731 aa）
链 D
1–731（731 aa）
链 E
1–731（731 aa）
链 F
1–731（731 aa）
链 G
1–731（731 aa）
链 J
1–731（731 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.25 Å |
| 9W90 DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1-c-Jun-STK40 complex 提交 2025-08-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–731（731 aa）
链 C
1–731（731 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |