当前蛋白身份：Q8R2H0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric（34） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric（34） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric（34） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6VQ9 Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 1 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6VQA Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VQB Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6VQI Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 6VQJ Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 6VQK Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 9B8P Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, V1 提交 2024-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9B8Q Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, peripheral stalks 提交 2024-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 M
1–118（118 aa）
链 N
1–118（118 aa）
链 O
1–118（118 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |