当前蛋白身份:Q8SDD3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3J0H Fitting of the bacteriophage phiKZ gp29PR structure into the cryo-EM density map of the phiKZ extended tail sheath 提交 2011-08-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 B 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 C 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 D 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 E 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 F 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;liquid ethane
分辨率 18.00 Å
3J0I Fitting of the phiKZ gp29PR structure into the cryo-EM density map of the phiKZ polysheath 提交 2011-08-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 B 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 C 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 D 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 E 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 F 96–390(295 aa) 片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;liquid ethane
分辨率 19.00 Å
3SPE Crystal structure of the tail sheath protein protease resistant fragment from bacteriophage phiKZ 提交 2011-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 96–390(295 aa) 片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;1.8 M Na/K Phosphate, pH 5.0 with 0.1 M Na Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.286
3SPE Crystal structure of the tail sheath protein protease resistant fragment from bacteriophage phiKZ 提交 2011-07-01 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 96–390(295 aa) 片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;1.8 M Na/K Phosphate, pH 5.0 with 0.1 M Na Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.286
3SPE Crystal structure of the tail sheath protein protease resistant fragment from bacteriophage phiKZ 提交 2011-07-01 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 96–390(295 aa) 片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
链 B 96–390(295 aa) 片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;1.8 M Na/K Phosphate, pH 5.0 with 0.1 M Na Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.286
9XPF The structure of sheath and tube proteins of phage Phikz 提交 2025-11-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 1–695(695 aa)
链 B 1–695(695 aa)
链 C 1–695(695 aa)
链 D 1–695(695 aa)
链 E 1–695(695 aa)
链 F 1–695(695 aa)
链 M 1–695(695 aa)
链 N 1–695(695 aa)
链 O 1–695(695 aa)
链 P 1–695(695 aa)
链 Q 1–695(695 aa)
链 R 1–695(695 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
9XPS The neck structure of the Phage Phikz 提交 2025-11-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 x 1–695(695 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
9XQS Structure of the inner peripheral region in the phage phiKZ baseplate complex 提交 2025-11-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 84 PDB 声明:84-meric(84) 与蛋白数一致
链 W 1–695(695 aa)
链 X 1–695(695 aa)
链 Y 1–695(695 aa)
链 Z 1–695(695 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å