当前蛋白身份:Q8SDD3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3J0H Fitting of the bacteriophage phiKZ gp29PR structure into the cryo-EM density map of the phiKZ extended tail sheath 提交 2011-08-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 B
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 C
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 D
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 E
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 F
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;liquid ethane
|
分辨率 18.00 Å |
| 3J0I Fitting of the phiKZ gp29PR structure into the cryo-EM density map of the phiKZ polysheath 提交 2011-08-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 B
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 C
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 D
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 E
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
链 F
96–390(295 aa)
片段:protease-resistant fragment of gene product 29 (GP29PR, UNP residues 96-390)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;liquid ethane
|
分辨率 19.00 Å |
| 3SPE Crystal structure of the tail sheath protein protease resistant fragment from bacteriophage phiKZ 提交 2011-07-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
96–390(295 aa)
片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;1.8 M Na/K Phosphate, pH 5.0 with 0.1 M Na Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.286 |
| 3SPE Crystal structure of the tail sheath protein protease resistant fragment from bacteriophage phiKZ 提交 2011-07-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
96–390(295 aa)
片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;1.8 M Na/K Phosphate, pH 5.0 with 0.1 M Na Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.286 |
| 3SPE Crystal structure of the tail sheath protein protease resistant fragment from bacteriophage phiKZ 提交 2011-07-01 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
96–390(295 aa)
片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
链 B
96–390(295 aa)
片段:Protease Resistant Fragment of Gene Product 29 (GP29PR) (UNP residues 96-390)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;1.8 M Na/K Phosphate, pH 5.0 with 0.1 M Na Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.286 |
| 9XPF The structure of sheath and tube proteins of phage Phikz 提交 2025-11-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 A
1–695(695 aa)
链 B
1–695(695 aa)
链 C
1–695(695 aa)
链 D
1–695(695 aa)
链 E
1–695(695 aa)
链 F
1–695(695 aa)
链 M
1–695(695 aa)
链 N
1–695(695 aa)
链 O
1–695(695 aa)
链 P
1–695(695 aa)
链 Q
1–695(695 aa)
链 R
1–695(695 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.15 Å |
| 9XPS The neck structure of the Phage Phikz 提交 2025-11-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致 |
链 x
1–695(695 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 9XQS Structure of the inner peripheral region in the phage phiKZ baseplate complex 提交 2025-11-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 84 PDB 声明:84-meric(84) 与蛋白数一致 |
链 W
1–695(695 aa)
链 X
1–695(695 aa)
链 Y
1–695(695 aa)
链 Z
1–695(695 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |