当前蛋白身份:Q8TAT6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
11SY Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (NPL4 focused) 提交 2026-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 G 2–608(607 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6;50 mM HEPES, pH 7.6, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
11TA Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (motor focused) 提交 2026-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 G 2–608(607 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6;50 mM HEPES, pH 7.6, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
11VE Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (State1) 提交 2026-03-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 G 1–608(608 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
7WWP Crystal structure of human Npl4 提交 2022-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 91–560(470 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;0.1 M HEPES (pH6.5), 16 % (w/v) PEG 3350, and 5 % (v/v) MPD
分辨率 2.99 Å R-free 0.290
7WWQ Crystal structure of human Ufd1-Npl4 complex 提交 2022-02-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 96–560(465 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;295 K;0.1M Tris-HCl (pH8.5), 5 % (v/v) glycerol, and 1.3 M magnesium sulfate hydrate
分辨率 2.72 Å R-free 0.277
9YRC p97Ufd1-Npl4 complex processing poly-ubiquitinated substrate in the presence of ATP 提交 2025-10-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 G 1–608(608 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å