当前蛋白身份：Q8TDZ2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1WYL Solution structure of the CH domain of human NEDD9 interacting protein with calponin homology and LIM domains 提交 2005-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
510–612（103 aa）
片段：CH domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.22mM CH domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2CO8 Solution structures of the LIM domain of human NEDD9 interacting protein with calponin homology and LIM domains 提交 2005-05-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
687–755（69 aa）
片段：LIM domain
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1mM LIM domain U-15N,13C; 20mM d-Tris HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 0.01mM ZnCl2; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2DK9 Solution structure of Calponin Homology domain of Human MICAL-1 提交 2006-04-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
506–614（109 aa）
片段：Calponin Homology domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM phosphate buffer, 50mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
1.5mM MICAL_1 CH U-15N,13C; 50mM phosphate buffer, 50mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5mM MICAL_1 CH U-15N; 50mM phosphate buffer, 50mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5mM MICAL_1 CH U-15N,13C; 50mM phosphate buffer, 50mM NaCl; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1.5mM MICAL_1 CH U-15N; 50mM phosphate buffer, 50mM NaCl; 17 mg/mL Pf1 filamentous phage; 90% H2O, 10% D2O | 17 mg/mL Pf1 filamentous phage; 90% H2O, 10% D2O
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分辨率未提供 |
| 5LE0 MICAL1 Cterminal domain 提交 2016-06-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
918–1067（150 aa）
片段：UNP residues 918-1067
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；EG
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分辨率 3.30 Å R-free 0.306 |
| 5LPN Structure of human Rab10 in complex with the bMERB domain of Mical-1 提交 2016-08-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
918–1067（150 aa）
片段：UNP residues 918-1067
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6%-10% PEG8000
0.1M Imidazole
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分辨率 2.80 Å R-free 0.287 |
| 6KU0 Crystal structure of MyoVa-GTD in complex with MICAL1-GTBM 提交 2019-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
799–822（24 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1% w/v Tryptone, 0.05M HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
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分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 6KU0 Crystal structure of MyoVa-GTD in complex with MICAL1-GTBM 提交 2019-08-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
799–822（24 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1% w/v Tryptone, 0.05M HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 8HLO Crystal structure of ASAP1-SH3 and MICAL1-PRM complex 提交 2022-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
828–836（9 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；289.15 K；0.1M HEPES, pH 7.5, 1.4M Sodium citrate tribasic dihydrate
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分辨率 1.17 Å R-free 0.142 |
| 8Y6K Cryo-EM structure of full-length MICAL1 in the autoinhibited state 提交 2024-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1067（1067 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris, pH 7.5, 100 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.94 Å |
| 9EWY CryoEM structure of human MICAL1 提交 2024-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1067（1067 aa）
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未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 9G0C Structure of human Mical1 bMERB_V978A_V985A domain:Rab10 complex. 提交 2024-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
918–1067（150 aa）
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突变：V978A, V985A | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.17 M Sodium acetate, 0.085 M Tris-HCl pH 8.5, 25.5% (w/v) PEG 4000 and 15% (v/v) glycerol
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分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 9G0D Structure of human Mical1 bMERB_V978A domain:Rab10 complex. 提交 2024-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
918–1067（150 aa）
|
突变：V978A | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Imidazole pH 8.0, 5% (w/v) PEG 3000 and 30% (v/v) PEG 200
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分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |