当前蛋白身份:Q8V635
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6HBG Echovirus 18 native particle 提交 2018-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 240 PDB 声明:240-meric(240) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
链 D
1–69(69 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 60 GUN GUANINE × 60 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.325 |
| 6HBH Echovirus 18 A-particle 提交 2018-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.323 |
| 6HBH Echovirus 18 A-particle 提交 2018-08-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.323 |
| 6HBH Echovirus 18 A-particle 提交 2018-08-10 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.323 |
| 6HBH Echovirus 18 A-particle 提交 2018-08-10 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.323 |
| 6HBH Echovirus 18 A-particle 提交 2018-08-10 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.323 |
| 6HBJ Echovirus 18 empty particle 提交 2018-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.336 |
| 6HBJ Echovirus 18 empty particle 提交 2018-08-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.336 |
| 6HBJ Echovirus 18 empty particle 提交 2018-08-10 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.336 |
| 6HBJ Echovirus 18 empty particle 提交 2018-08-10 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.336 |
| 6HBJ Echovirus 18 empty particle 提交 2018-08-10 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.336 |
| 6HBK Echovirus 18 Open particle without one pentamer 提交 2018-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 165 PDB 声明:165-meric(165) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–328(259 aa)
链 C
330–568(239 aa)
链 D
569–855(287 aa)
链 E
70–328(259 aa)
链 F
330–568(239 aa)
链 G
569–855(287 aa)
链 H
70–328(259 aa)
链 I
330–568(239 aa)
链 J
569–855(287 aa)
链 K
70–328(259 aa)
链 L
330–568(239 aa)
链 M
569–855(287 aa)
链 N
70–328(259 aa)
链 O
330–568(239 aa)
链 P
569–855(287 aa)
链 Q
70–328(259 aa)
链 R
330–568(239 aa)
链 S
569–855(287 aa)
链 T
70–328(259 aa)
链 U
330–568(239 aa)
链 V
569–855(287 aa)
链 W
70–328(259 aa)
链 X
330–568(239 aa)
链 Y
569–855(287 aa)
链 Z
70–328(259 aa)
链 a
330–568(239 aa)
链 b
569–855(287 aa)
链 c
70–328(259 aa)
链 d
330–568(239 aa)
链 e
569–855(287 aa)
链 f
70–328(259 aa)
链 g
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6HBL Echovirus 18 Open particle without three pentamers 提交 2018-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 135 PDB 声明:45-meric(45) 待复核 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
链 D
569–855(287 aa)
链 E
70–329(260 aa)
链 F
330–568(239 aa)
链 G
569–855(287 aa)
链 H
70–329(260 aa)
链 I
330–568(239 aa)
链 J
569–855(287 aa)
链 K
70–329(260 aa)
链 L
330–568(239 aa)
链 M
569–855(287 aa)
链 N
70–329(260 aa)
链 O
330–568(239 aa)
链 P
569–855(287 aa)
链 Q
70–329(260 aa)
链 R
330–568(239 aa)
链 S
569–855(287 aa)
链 T
70–329(260 aa)
链 U
330–568(239 aa)
链 V
569–855(287 aa)
链 W
70–329(260 aa)
链 X
330–568(239 aa)
链 Y
569–855(287 aa)
链 Z
70–329(260 aa)
链 a
330–568(239 aa)
链 b
569–855(287 aa)
链 c
70–329(260 aa)
链 d
330–568(239 aa)
链 e
569–855(287 aa)
链 f
70–329(260 aa)
链 g
330–568(239 aa)
链 h
569–855(287 aa)
链 i
70–329(260 aa)
链 j
330–568(239 aa)
链 k
569–855(287 aa)
链 l
70–329(260 aa)
链 m
330–568(239 aa)
链 n
569–855(287 aa)
链 o
70–329(260 aa)
链 p
330–568(239 aa)
链 q
569–855(287 aa)
链 r
70–329(260 aa)
链 s
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6HHT Echovirus 18 Open particle without two pentamers 提交 2018-08-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 150 PDB 声明:150-meric(150) 与蛋白数一致 |
链 A1
569–855(287 aa)
链 A2
569–855(287 aa)
链 B1
70–329(260 aa)
链 B2
70–329(260 aa)
链 C1
330–568(239 aa)
链 C2
330–568(239 aa)
链 D1
569–855(287 aa)
链 D2
569–855(287 aa)
链 E1
70–329(260 aa)
链 E2
70–329(260 aa)
链 F1
330–568(239 aa)
链 F2
330–568(239 aa)
链 G1
569–855(287 aa)
链 G2
569–855(287 aa)
链 H1
70–329(260 aa)
链 H2
70–329(260 aa)
链 I1
330–568(239 aa)
链 I2
330–568(239 aa)
链 J1
569–855(287 aa)
链 J2
569–855(287 aa)
链 K1
70–329(260 aa)
链 K2
70–329(260 aa)
链 L1
330–568(239 aa)
链 L2
330–568(239 aa)
链 M1
569–855(287 aa)
链 M2
569–855(287 aa)
链 N1
70–329(260 aa)
链 N2
70–329(260 aa)
链 O1
330–568(239 aa)
链 O2
330–568(239 aa)
链 P1
569–855(287 aa)
链 P2
569–855(287 aa)
链 Q1
70–329(260 aa)
链 Q2
70–329(260 aa)
链 R1
330–568(239 aa)
链 R2
330–568(239 aa)
链 S1
569–855(287 aa)
链 S2
569–855(287 aa)
链 T1
70–329(260 aa)
链 T2
70–329(260 aa)
链 U1
330–568(239 aa)
链 U2
330–568(239 aa)
链 V1
569–855(287 aa)
链 V2
569–855(287 aa)
链 W1
70–329(260 aa)
链 W2
70–329(260 aa)
链 X1
330–568(239 aa)
链 X2
330–568(239 aa)
链 Y2
569–855(287 aa)
链 Z2
70–329(260 aa)
链 a2
330–568(239 aa)
链 b2
569–855(287 aa)
链 c2
70–329(260 aa)
链 d2
330–568(239 aa)
链 e2
569–855(287 aa)
链 f2
70–329(260 aa)
链 g2
330–568(239 aa)
链 h2
569–855(287 aa)
链 i2
70–329(260 aa)
链 j2
330–568(239 aa)
链 k2
569–855(287 aa)
链 l2
70–329(260 aa)
链 m2
330–568(239 aa)
链 n2
569–855(287 aa)
链 o2
70–329(260 aa)
链 p2
330–568(239 aa)
链 q2
569–855(287 aa)
链 r2
70–329(260 aa)
链 s2
330–568(239 aa)
链 t2
569–855(287 aa)
链 u2
70–329(260 aa)
链 v2
330–568(239 aa)
链 w2
569–855(287 aa)
链 x2
70–329(260 aa)
链 y2
330–568(239 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |
| 7B5F Structure of echovirus 18 in complex with neonatal Fc receptor 提交 2020-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
569–855(287 aa)
链 B
70–329(260 aa)
链 C
330–568(239 aa)
链 D
1–69(69 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 GUN GUANINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3;Mixed in 1:1 volume ratio
{20 mM Tris (pH=7.2), 100 mM NaCl} and {8 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4 (pH=7.4), 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl}=PBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.311 |