当前蛋白身份:Q8VGC3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1T0H Crystal structure of the Rattus norvegicus voltage gated calcium channel beta subunit isoform 2a 提交 2004-04-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–145(129 aa) 片段:residues 17-145
链 B 203–425(223 aa) 片段:residues 203-425
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;281 K;Tris-Cl, NaCl, PEG 4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 1.97 Å R-free 0.213
1T0H Crystal structure of the Rattus norvegicus voltage gated calcium channel beta subunit isoform 2a 提交 2004-04-08 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–145(129 aa) 片段:residues 17-145
链 B 203–425(223 aa) 片段:residues 203-425
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;281 K;Tris-Cl, NaCl, PEG 4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 1.97 Å R-free 0.213
1T0J Crystal structure of a complex between voltage-gated calcium channel beta2a subunit and a peptide of the alpha1c subunit 提交 2004-04-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 17–145(129 aa) 片段:residues 17-145
链 B 203–425(223 aa) 片段:residues 203-425
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Tris-Cl, PEG 4000, NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.242
1T0J Crystal structure of a complex between voltage-gated calcium channel beta2a subunit and a peptide of the alpha1c subunit 提交 2004-04-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 17–145(129 aa) 片段:residues 17-145
链 B 203–425(223 aa) 片段:residues 203-425
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Tris-Cl, PEG 4000, NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.242
3JBR Cryo-EM structure of the rabbit voltage-gated calcium channel Cav1.1 complex at 4.2 angstrom 提交 2015-09-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 68–196(129 aa)
链 B 254–475(222 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 BMA beta-D-mannopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20mM MOPS, 200mM NaCl, 0.5mM CaCl2,0.1% digitonin;pH 7.4;20mM MOPS, 200mM NaCl, 0.5mM CaCl2,0.1% digitonin
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2 seconds before plunging;冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5V2P CaV beta2a subunit: CaV1.2 AID-CAP complex 提交 2017-03-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 24–145(122 aa) 片段:beta2a subunit (UNP residues 24-145,254-476)
链 A 254–476(223 aa) 片段:beta2a subunit (UNP residues 24-145,254-476)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 8VY 1,3-bis(bromomethyl)benzene × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;277 K;34-37% PEG400, 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M MES, pH 6.3
分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5V2Q CaV beta2a subunit: CaV1.2 AID-CEN complex 提交 2017-03-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 68–189(122 aa) 片段:beta2a subunit (UNP residues 68-189,203-425)
链 A 203–425(223 aa) 片段:beta2a subunit (UNP residues 68-189,203-425)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 8VY 1,3-bis(bromomethyl)benzene × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;1.5-1.7 M ammonium sulfate, 5 mM BME, 0.1 M HEPES, pH 7.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.196