当前蛋白身份:Q8WUM4 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2OEV Crystal structure of ALIX/AIP1 提交 2007-01-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–698(698 aa) 片段:Bro1-V Domains, residues 1-698
突变:K268Y, K269Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;286 K;8% PEG 4000, 0.1M ammonium acetate, 0.1M magnesium acetate, 0.05M hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 286K
分辨率 3.30 Å R-free 0.317
2OEW Structure of ALIX/AIP1 Bro1 Domain 提交 2007-01-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–359(359 aa) 片段:Bro1 Domain, residues 1-359
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;286 K;10% PEG 20000, 0.1M NaMES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 286K
分辨率 2.55 Å R-free 0.274
2OEX Structure of ALIX/AIP1 V Domain 提交 2007-01-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 360–702(343 aa) 片段:V Domain, residues 359-702
链 B 360–702(343 aa) 片段:V Domain, residues 359-702
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;277 K;14% PEG 3350, 0.16M magnesium formate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.58 Å R-free 0.302
2OJQ Crystal structure of Alix V domain 提交 2007-01-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 360–702(343 aa) 片段:V domain, residues 360-702
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;13-15% PEG 6000, 6-10% ethylene glycol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.87 Å R-free 0.318
2R02 Crystal Structure of ALIX/AIP1 in complex with the HIV-1 YPLTSL Late Domain 提交 2007-08-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–698(697 aa) 片段:ALIX Bro1-V domains
突变:K268Y,K269Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop vapor diffusion;pH 5.9;286 K;0.20-0.25 M MgCl2, 7-10% PEG 4000, 0.1 M NaMES, pH 5.9, sitting drop vapor diffusion, temperature 286K
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
2R03 Crystal Structure of ALIX/AIP1 in complex with the YPDL Late Domain 提交 2007-08-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–698(697 aa) 片段:ALIX Bro1-V domains
突变:K268Y,K269Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.9;286 K;0.20-0.25 M MgCl2, 7-10% PEG 4000, 0.1 M NaMES, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 286K
分辨率 2.59 Å R-free 0.286
2R05 Crystal Structure of ALIX/AIP1 in complex with the HIV-1 YPLASL Late Domain 提交 2007-08-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–698(697 aa) 片段:ALIX Bro1-V domains
突变:K268Y,K269Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.9;286 K;0.20-0.25 M MgCl2, 7-10% PEG 4000, 0.1 M NaMES, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 286K
分辨率 2.55 Å R-free 0.280
2XS1 Crystal Structure of ALIX in complex with the SIVmac239 PYKEVTEDL Late Domain 提交 2010-09-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–698(698 aa) 片段:BRO1-V DOMAINS, RESIDUES 1-698
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.2;6.5% PEG4000, 0.2 MGCL2, 0.1M MES PH 6.2
分辨率 2.30 Å R-free 0.252
2XS8 Crystal Structure of ALIX in complex with the SIVagmTan-1 AYDPARKLL Late Domain 提交 2010-09-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–698(698 aa) 片段:BRO1-V DOMAINS, RESIDUES 1-698
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.1;6.1% PEG4000, 0.2M MGCL2, 0.1M MES PH 6.1
分辨率 2.50 Å R-free 0.261
2ZNE Crystal structure of Zn2+-bound form of des3-23ALG-2 complexed with Alix ABS peptide 提交 2008-04-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 799–814(16 aa) 片段:ALG-2 binding site, residues 799-814
突变:C15S ZN ZINC ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;10% 2-propanol, 0.1M Cacodylate, 0.2M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
2ZNE Crystal structure of Zn2+-bound form of des3-23ALG-2 complexed with Alix ABS peptide 提交 2008-04-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 799–814(16 aa) 片段:ALG-2 binding site, residues 799-814
突变:C15S ZN ZINC ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;10% 2-propanol, 0.1M Cacodylate, 0.2M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
2ZNE Crystal structure of Zn2+-bound form of des3-23ALG-2 complexed with Alix ABS peptide 提交 2008-04-22 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 799–814(16 aa) 片段:ALG-2 binding site, residues 799-814
链 D 799–814(16 aa) 片段:ALG-2 binding site, residues 799-814
突变:C15S 突变:C15S ZN ZINC ION × 8 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;10% 2-propanol, 0.1M Cacodylate, 0.2M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
3C3O ALIX Bro1-domain:CHMIP4A co-crystal structure 提交 2008-01-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–359(359 aa) 片段:BRO1 domain (UNP residues 1-358)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;15% PEG 8,000, 100mM Na MES pH 6.5, 200mM Na Acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.15 Å R-free 0.284
3C3Q ALIX Bro1-domain:CHMIP4B co-crystal structure 提交 2008-01-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–359(359 aa) 片段:BRO1 domain (UNP residues 1-359)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;15% PEG 8,000, 100mM Na MES pH 6.5, 200mM Na Acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.290
3C3R ALIX BRO1 CHMP4C complex 提交 2008-01-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–359(359 aa) 片段:BRO1 domain (UNP residues 1-359)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;10% PEG 2,000, 100mM Na MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.02 Å R-free 0.288
3E1R Midbody targeting of the ESCRT machinery by a non-canonical coiled-coil in CEP55 提交 2008-08-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 797–809(13 aa) 片段:UNP residues 797-809
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;294 K;100 mM MES, 22% PEG 6000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
3WUV Structure basis of inactivating cell abscission with chimera peptide 2 提交 2014-05-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 796–809(14 aa)
突变:P796D/P807I/G808P/Y809P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;0.8M ammonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.79 Å R-free 0.227
3WUV Structure basis of inactivating cell abscission with chimera peptide 2 提交 2014-05-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 796–809(14 aa)
突变:P796D/P807I/G808P/Y809P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;0.8M ammonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.79 Å R-free 0.227
3WUV Structure basis of inactivating cell abscission with chimera peptide 2 提交 2014-05-05 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 I 796–809(14 aa)
突变:P796D/P807I/G808P/Y809P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;0.8M ammonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.79 Å R-free 0.227
3WUV Structure basis of inactivating cell abscission with chimera peptide 2 提交 2014-05-05 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 L 796–809(14 aa)
突变:P796D/P807I/G808P/Y809P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;0.8M ammonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.79 Å R-free 0.227
3WUV Structure basis of inactivating cell abscission with chimera peptide 2 提交 2014-05-05 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 O 796–809(14 aa)
突变:P796D/P807I/G808P/Y809P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;0.8M ammonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.79 Å R-free 0.227
3WUV Structure basis of inactivating cell abscission with chimera peptide 2 提交 2014-05-05 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 R 796–809(14 aa)
突变:P796D/P807I/G808P/Y809P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;0.8M ammonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.79 Å R-free 0.227
4JJY Alix V domain 提交 2013-03-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 355–708(354 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;0.1 M sodium citrate pH 5, 6-8% PEG 8000, 5-10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 6.50 Å R-free 0.283
4JJY Alix V domain 提交 2013-03-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 355–708(354 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;0.1 M sodium citrate pH 5, 6-8% PEG 8000, 5-10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 6.50 Å R-free 0.283
5V3R CHMP4C in complex with ALIX BRO1 提交 2017-03-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–359(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;10% PEG20000, 100 mM MES, pH 6.5
分辨率 1.91 Å R-free 0.213
5WA1 CHMP4C A232T in complex with ALIX BRO1 提交 2017-06-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–358(358 aa) 片段:Bro1 domain (UNP residues 1-358)
突变:A232T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG8000, 100 mM MES, pH 6.5, 200 mM sodium acetate
分辨率 1.87 Å R-free 0.215
6KP3 STRUCTURE OF SENDAI VIRUS Y3/ALIX-BRO1 DOMAIN COMPLEX 提交 2019-08-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–359(359 aa) 片段:bro1 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.45;297 K;15% PEG 3350, 0.2M Sodium Malonate-NaOH
分辨率 2.20 Å R-free 0.262