当前蛋白身份：Q8WVM0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6AAX Crystal structure of TFB1M and h45 with SAM in homo sapiens 提交 2018-07-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
28–346（319 aa）
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未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M potassium chloride, 0.025M magnesium sulfate hydrate, 0.05M HEPES sodium, pH 7.0, 20% v/v polyethylene glycol 200
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.271 |
| 6AAX Crystal structure of TFB1M and h45 with SAM in homo sapiens 提交 2018-07-19 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 C
28–346（319 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M potassium chloride, 0.025M magnesium sulfate hydrate, 0.05M HEPES sodium, pH 7.0, 20% v/v polyethylene glycol 200
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.271 |
| 6AJK Crystal structure of TFB1M and h45 in homo sapiens 提交 2018-08-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
28–346（319 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M sodium citrate, pH 5.0, 20% PEG 8000
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分辨率 3.00 Å R-free 0.241 |
| 8CSP Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State A) 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致 |
链 5
1–346（346 aa）
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未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 28 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å |
| 8CSQ Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State B) 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致 |
链 5
1–346（346 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 27 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.54 Å |
| 8CSR Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State C) 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 5
1–346（346 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 31 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.54 Å |
| 8CSU Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State C*) 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致 |
链 5
1–346（346 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 26 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9G5B Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit (State A) 提交 2024-07-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 c
1–346（346 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9H55 Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit in complex with NOA1 and TFB1M (state N3) 提交 2024-10-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 5
1–346（346 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 41 K POTASSIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |