当前蛋白身份：Q8WWN8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2KG5 NMR Solution structure of ARAP3-SAM 提交 2009-03-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–80（80 aa）
片段：SAM Domain, residues 1-80
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.7；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM protein, 2.7 mM potassium chloride, 137 mM sodium chloride, 11.9 mM phosphates, 0.3% mM sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] protein, 2.7 mM potassium chloride, 137 mM sodium chloride, 11.9 mM phosphates, 0.3% mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 2.7 mM potassium chloride, 137 mM sodium chloride, 11.9 mM phosphates, 0.3% mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LNW Identification and structural basis for a novel interaction between Vav2 and Arap3 提交 2012-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1404–1412（9 aa）
片段：UNP RESIDUES 1404-1412
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 3 mM entity_2-2, 5 mM potassium phosphate-3, 20 mM sodium phosphate-4, 5 mM DTT-5, 2 mM EDTA-6, 75 mM sodium chloride-7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-8, 3 mM entity_2-9, 5 mM potassium phosphate-10, 75 mM sodium chloride-11, 5 mM DTT-12, 2 mM EDTA-13, 20 mM sodium phosphate-14, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5JCP RhoGAP domain of ARAP3 in complex with RhoA in the transition state 提交 2016-04-15 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
906–1107（202 aa）
片段：UNP residues 906-1107,UNP residues 2-181
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突变：F25N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；100 mM MES, 15%(v/v) PEG 550 MME, 4%(v/v) Acetone
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.227 |
| 5JCP RhoGAP domain of ARAP3 in complex with RhoA in the transition state 提交 2016-04-15 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
906–1107（202 aa）
片段：UNP residues 906-1107,UNP residues 2-181
|
突变：F25N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；100 mM MES, 15%(v/v) PEG 550 MME, 4%(v/v) Acetone
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.227 |
| 5JD0 crystal structure of ARAP3 RhoGAP domain 提交 2016-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
906–1107（202 aa）
片段：UNP residues 906-1107
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；100 mM HEPES, 10% PEG8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 5JD0 crystal structure of ARAP3 RhoGAP domain 提交 2016-04-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
906–1107（202 aa）
片段：UNP residues 906-1107
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；100 mM HEPES, 10% PEG8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 7A9B Crystal structure of Shank1 PDZ domain with ARAP3-derived peptide 提交 2020-09-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1414–1429（16 aa）
链 B
1414–1429（16 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 nL of protein solution (15 mg/ml mutant protein in 10 mM HEPES buffer, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol and 0.5 mM TCEP) were mixed with 100 nL reservoir buffer (16% (w/v) polyethylene glycol 3350 and 0.2 M ammonium citrate), above a reservoir volume of 20 microL
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 7YIR Crystal structure of N-terminal PH domain of ARAP3 protein from human 提交 2022-07-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
284–385（102 aa）
片段：PH1 domain
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05 M Calcium chloride dihydrate, 0.1 M BIS-TRIS (pH 6.5), 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.230 |
| 7YIS Crystal structure of N-terminal PH domain of ARAP3 protein in complex with inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate 提交 2022-07-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
284–385（102 aa）
片段：PH1 domain
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未记录 | 4PT (2R)-3-{[(S)-{[(2S,3R,5S,6S)-2,6-DIHYDROXY-3,4,5-TRIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-2-(1-HYDROXY BUTOXY)PROPYL BUTYRATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate (pH 4.6), 30% v/v Polyethylene glycol 400
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分辨率 3.30 Å R-free 0.276 |