当前蛋白身份:Q92608 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2RQR The solution structure of human DOCK2 SH3 domain - ELMO1 peptide chimera complex 提交 2009-10-21 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 8–70(63 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 ambient
NMR样品组成 1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 20mM [U-2H] TRIS-2, 100mM sodium chloride-3, 0.02% sodium azide-4, 1mM [U-2H] DTT-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2YIN STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN Dock2 AND Rac1. 提交 2011-05-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1192–1622(431 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1192-1622
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;293 K;0.1 M MES PH 6.5, 12% (W/V) PEG 3350, 10% (V/V) GLYCEROL AND 150 MM NACL. AT 20 C
分辨率 2.70 Å R-free 0.255
2YIN STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN Dock2 AND Rac1. 提交 2011-05-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1192–1622(431 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1192-1622
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;293 K;0.1 M MES PH 6.5, 12% (W/V) PEG 3350, 10% (V/V) GLYCEROL AND 150 MM NACL. AT 20 C
分辨率 2.70 Å R-free 0.255
3A98 Crystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1 提交 2009-10-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–177(177 aa) 片段:N-terminal domains, SH3 domain, residues 1-177
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;12% PEG 3350, 0.1M di-ammonium hydrogen citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.268
3A98 Crystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1 提交 2009-10-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–177(177 aa) 片段:N-terminal domains, SH3 domain, residues 1-177
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;12% PEG 3350, 0.1M di-ammonium hydrogen citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.268
3B13 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK2 in complex with Rac1 (T17N mutant) 提交 2011-06-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1196–1622(427 aa) 片段:DHR-2 domain (UNP RESIDUES 1196-1622)
链 C 1196–1622(427 aa) 片段:DHR-2 domain (UNP RESIDUES 1196-1622)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;100mM sodium citrate, 15% PEG 6000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.01 Å R-free 0.234
6TGB CryoEM structure of the binary DOCK2-ELMO1 complex 提交 2019-11-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–1830(1830 aa)
链 D 1–1830(1830 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6TGC CryoEM structure of the ternary DOCK2-ELMO1-RAC1 complex. 提交 2019-11-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–1830(1830 aa)
链 D 1–1830(1830 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å