当前蛋白身份：Q92736
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4JKQ Crystal structure of the N-terminal region of the human ryanodine receptor 2 提交 2013-03-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–606（606 aa）
片段：N-terminal region
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；20 mM TRIS-HCl, 150 mM NaCl, 10% glycerol, 7mM mercaptoethanol, 1 mM CHAPS, 0.1% betaine, 100 mM HEPES, 200 mM ammonium formate, 21% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.261 |
| 7KL5 Structure of Calmodulin Bound to the Cardiac Ryanodine Receptor (RyR2) at Residues: Phe4246 to Val4271 提交 2020-10-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
4246–4275（30 aa）
片段：Phe4246 to Thr4275
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M sodium acetate, 0.1M Tris pH 8.5, 30%(w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.245 |
| 7U9Q Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the closed state 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 7U9R Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the open state 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 7U9T Structure of PKA phosphorylated human RyR2 in the closed state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 7U9X Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 7U9Z Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the open state 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 7UA1 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state in the presence of ARM210 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 7UA3 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the closed state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 7UA4 Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R2474S in the open state in the presence of Calmodulin 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å |
| 7UA5 Structure of dephosphorylated human RyR2 in the closed state 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 7UA9 Structure of dephosphorylated human RyR2 in the open state 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 XAN XANTHINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Xanthine was made fresh to avoid aggregation. Xanthine stock solution was 10 mM in NaOH 0.5 N.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 8UQ2 Structure of human RyR2-S2808D in the subprimed state 提交 2023-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
突变：S2808D 突变：S2808D 突变：S2808D 突变：S2808D | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 8UQ3 Structure of human RyR2-S2808D in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 8UQ4 Structure of human RyR2-S2808D in the subprimed state in the presence of H2O2/NOC-12/GSH 提交 2023-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 minute incubation with H2O2/NOC-12/GSH was stopped by flash freezing (vitrobot)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |
| 8UQ5 Structure of human RyR2-S2808D in the primed state in the presence of Rapamycin 提交 2023-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30-minute incubation with rapamycin was stopped by flash freezing (vitrobot)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.96 Å |
| 8UXC Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420Q in the primed state 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
突变：R420Q 突变：R420Q 突变：R420Q 突变：R420Q | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8UXE Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420Q in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 8UXF Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 8UXG Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the closed state in the presence of ARM210 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 8UXH Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state in the presence of calcium 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 8UXI Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the open state in the presence of calcium 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8UXL Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the primed state in the presence of calcium and calmodulin 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；0.020 mM Calmodulin was added to the final sample
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 8UXM Structure of PKA phosphorylated human RyR2-R420W in the open state in the presence of calcium and calmodulin 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4967（4967 aa）
链 B
1–4967（4967 aa）
链 C
1–4967（4967 aa）
链 D
1–4967（4967 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；0.020 mM Calmodulin was added to the final sample
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |