当前蛋白身份：Q92784
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2KWJ Solution structures of the double PHD fingers of human transcriptional protein DPF3 bound to a histone peptide containing acetylation at lysine 14 提交 2010-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
261–372（112 aa）
片段：PHD-types 1 and 2 residues 261-372
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
100 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KWK Solution structures of the double PHD fingers of human transcriptional protein DPF3b bound to a H3 peptide wild type 提交 2010-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
261–372（112 aa）
片段：PHD-types 1 and 2 residues 261-372
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
100 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KWN Solution structure of the double PHD (plant homeodomain) fingers of human transcriptional protein DPF3b bound to a histone H4 peptide containing acetylation at Lysine 16 提交 2010-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
261–372（112 aa）
片段：PHD-types 1 and 2 residues 261-372
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KWO Solution structure of the double PHD (plant homeodomain) fingers of human transcriptional protein DPF3b bound to a histone H4 peptide containing N-terminal acetylation at Serine 1 提交 2010-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
261–372（112 aa）
片段：PHD-types 1 and 2 residues 261-372
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5I3L DPF3b in complex with H3K14ac peptide 提交 2016-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
254–368（115 aa）
链 B
254–368（115 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 32 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.4 M sodium citrate, 0.1 M HEPES, 5% MPD
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.212 |
| 5SZB Structure of human Dpf3 double-PHD domain bound to histone H3 tail peptide with acetylated K14 提交 2016-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
254–368（115 aa）
片段：double-PHD domain (UNP residues 254-368)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 4% MPD
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.155 |
| 5SZB Structure of human Dpf3 double-PHD domain bound to histone H3 tail peptide with acetylated K14 提交 2016-08-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
254–368（115 aa）
片段：double-PHD domain (UNP residues 254-368)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 4% MPD
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.155 |
| 5SZC Structure of human Dpf3 double-PHD domain bound to histone H3 tail peptide with monomethylated K4 and acetylated K14 提交 2016-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
254–368（115 aa）
片段：double-PHD domain (UNP residues 254-368)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 4% MPD
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.167 |
| 9UTH DPF3b in complex with H3K14cr peptide 提交 2025-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
255–368（114 aa）
链 C
255–368（114 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；4 M Sodium Formate, pH 7.0
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.230 |
| 9UTH DPF3b in complex with H3K14cr peptide 提交 2025-05-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
255–368（114 aa）
链 G
255–368（114 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；4 M Sodium Formate, pH 7.0
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.230 |