当前蛋白身份:Q92890 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
11SY Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (NPL4 focused) 提交 2026-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 P 1–307(307 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6;50 mM HEPES, pH 7.6, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
11TA Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (motor focused) 提交 2026-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 P 1–307(307 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6;50 mM HEPES, pH 7.6, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
11VE Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (State1) 提交 2026-03-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 P 1–307(307 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
5C1B p97-delta709-728 in complex with a UFD1-SHP peptide 提交 2015-06-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 U 221–241(21 aa) 片段:UNP residues 221-241
链 V 221–241(21 aa) 片段:UNP residues 221-241
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;6.5-7% PEG 4000, 0.4-0.6 M potassium acetate, 0.1 M MES pH 5.75
分辨率 3.08 Å R-free 0.240
7WWQ Crystal structure of human Ufd1-Npl4 complex 提交 2022-02-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 258–273(16 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;295 K;0.1M Tris-HCl (pH8.5), 5 % (v/v) glycerol, and 1.3 M magnesium sulfate hydrate
分辨率 2.72 Å R-free 0.277
9YRC p97Ufd1-Npl4 complex processing poly-ubiquitinated substrate in the presence of ATP 提交 2025-10-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 H 1–307(307 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9YW2 Complex structure of human p97 bound to Faf1 and Ufd1 (NTD focused) 提交 2025-10-23 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 I 1–307(307 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å