当前蛋白身份:Q92890
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11SY Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (NPL4 focused) 提交 2026-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 P
1–307(307 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6;50 mM HEPES, pH 7.6, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.28 Å |
| 11TA Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (motor focused) 提交 2026-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致 |
链 P
1–307(307 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6;50 mM HEPES, pH 7.6, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
| 11VE Cryo-EM structure of substrate engaged p97-Ufd1-NPL4-Faf1 complex (State1) 提交 2026-03-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 P
1–307(307 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.85 Å |
| 5C1B p97-delta709-728 in complex with a UFD1-SHP peptide 提交 2015-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 U
221–241(21 aa)
片段:UNP residues 221-241
链 V
221–241(21 aa)
片段:UNP residues 221-241
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未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;6.5-7% PEG 4000, 0.4-0.6 M potassium acetate, 0.1 M MES pH 5.75
|
分辨率 3.08 Å R-free 0.240 |
| 7WWQ Crystal structure of human Ufd1-Npl4 complex 提交 2022-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
258–273(16 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;295 K;0.1M Tris-HCl (pH8.5), 5 % (v/v) glycerol, and 1.3 M magnesium sulfate hydrate
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.277 |
| 9YRC p97Ufd1-Npl4 complex processing poly-ubiquitinated substrate in the presence of ATP 提交 2025-10-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 H
1–307(307 aa)
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.97 Å |
| 9YW2 Complex structure of human p97 bound to Faf1 and Ufd1 (NTD focused) 提交 2025-10-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 I
1–307(307 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.27 Å |