当前蛋白身份：Q96A08
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3WKJ The nucleosome containing human TSH2B 提交 2013-10-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–127（127 aa）
链 H
1–127（127 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.291 |
| 5GSU Crystal structure of nucleosome core particle consisting of human testis-specific histone variants, Th2A and Th2B 提交 2016-08-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–127（126 aa）
链 H
2–127（126 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；20mM Pottasium Cacodylate pH 6.0, 60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.257 |
| 5GT3 Crystal structure of nucleosome particle in the presence of human testis-specific histone variant, hTh2b 提交 2016-08-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–127（126 aa）
链 H
2–127（126 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 CL CHLORIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.258 |
| 8VLR Cryo-EM structure of native H2AK119bu nucleosome at 2.6 提交 2024-01-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
34–126（93 aa）
链 H
34–126（93 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |