当前蛋白身份：Q96LR5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Y6L Human ubiquitin conjugating enzyme E2E2 提交 2004-12-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
55–201（147 aa）
片段：Residues 55-201
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；298 K；2M (NH4)2SO4, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.246 |
| 1Y6L Human ubiquitin conjugating enzyme E2E2 提交 2004-12-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
55–201（147 aa）
片段：Residues 55-201
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；298 K；2M (NH4)2SO4, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.246 |
| 1Y6L Human ubiquitin conjugating enzyme E2E2 提交 2004-12-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
55–201（147 aa）
片段：Residues 55-201
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；298 K；2M (NH4)2SO4, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.246 |
| 6W9A RNF12 RING domain in complex with Ube2e2 提交 2020-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–201（172 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；20% PEG 3350,
100 mM Na/K phosphate,
100 mM bis-Tris propane
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 6W9A RNF12 RING domain in complex with Ube2e2 提交 2020-03-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
30–201（172 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；20% PEG 3350,
100 mM Na/K phosphate,
100 mM bis-Tris propane
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 9BJZ Structure of the human DDD-Ube2e2 complex 提交 2024-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
2–201（200 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9LTO Cryo-EM structure of DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2 complex 提交 2025-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–201（201 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å |
| 9LTR Cryo-EM structure of dimeric DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1 complex 提交 2025-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 J
1–201（201 aa）
链 K
1–201（201 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9LTZ protein structure of DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2 complex 提交 2025-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–201（201 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9LU1 protein structure of DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2 bound to COP1 dimer 提交 2025-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–201（201 aa）
|
突变：S76G,C139S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 9LUL Local refinement of stacked like DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1 complex (layer 1) 提交 2025-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 a
55–201（147 aa）
链 d
55–201（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.99 Å |
| 9M0Y Local refinement of stacked like DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1 complex (layer 2) 提交 2025-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–201（201 aa）
链 T
1–201（201 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.25 Å |
| 9W90 DDB1-DDA1-DET1-Ube2e2-COP1-c-Jun-STK40 complex 提交 2025-08-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 J
1–201（201 aa）
链 K
1–201（201 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |