当前蛋白身份：Q96QF0
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4LHX Crystal structure of nucleotide-free Rab8:Rabin8 提交 2013-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
173–248（76 aa）
片段：unp residues 157-232
链 F
173–248（76 aa）
片段：unp residues 157-232
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；18% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES. cryo solution (30% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES), pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.300 |
| 4LHX Crystal structure of nucleotide-free Rab8:Rabin8 提交 2013-07-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
173–248（76 aa）
片段：unp residues 157-232
链 D
173–248（76 aa）
片段：unp residues 157-232
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；18% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES. cryo solution (30% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES), pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.300 |
| 4LHY Crystal structure of GDP-bound Rab8:Rabin8 提交 2013-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
链 F
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；Nucleotide-free Rab8a1 184:Rabin8157-232 was crystallized in 18% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6. Before data collection, the complex crystal was protected with cryo solution (30% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6). In order to produce nucleotide-bound forms of Rab8:Rabin8 complexes, the nucleotide-free Rab8:Rabin8 crystals were soaked with cryo solution containing 30 % (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6 and 1 mM respective nucleotide GDP/GTP for one hour at 4 C, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.310 |
| 4LHY Crystal structure of GDP-bound Rab8:Rabin8 提交 2013-07-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
链 D
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；Nucleotide-free Rab8a1 184:Rabin8157-232 was crystallized in 18% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6. Before data collection, the complex crystal was protected with cryo solution (30% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6). In order to produce nucleotide-bound forms of Rab8:Rabin8 complexes, the nucleotide-free Rab8:Rabin8 crystals were soaked with cryo solution containing 30 % (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6 and 1 mM respective nucleotide GDP/GTP for one hour at 4 C, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.310 |
| 4LHZ Crystal structure of GTP-bound Rab8:Rabin8 提交 2013-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
链 F
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；Nucleotide-free Rab8a1 184:Rabin8157-232 was crystallized in 18% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6. Before data collection, the complex crystal was protected with cryo solution (30% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6). In order to produce nucleotide-bound forms of Rab8:Rabin8 complexes, the nucleotide-free Rab8:Rabin8 crystals were soaked with cryo solution containing 30 % (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6 and 1 mM respective nucleotide GDP/GTP for one hours at 278 K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.309 |
| 4LHZ Crystal structure of GTP-bound Rab8:Rabin8 提交 2013-07-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
链 D
173–248（76 aa）
片段：unp residues 173-248
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；Nucleotide-free Rab8a1 184:Rabin8157-232 was crystallized in 18% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6. Before data collection, the complex crystal was protected with cryo solution (30% (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6). In order to produce nucleotide-bound forms of Rab8:Rabin8 complexes, the nucleotide-free Rab8:Rabin8 crystals were soaked with cryo solution containing 30 % (w/v) PEG3350, 0.1 M Li2SO4, 0.1 M MES pH 6.6 and 1 mM respective nucleotide GDP/GTP for one hours at 278 K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.309 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 N
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 T
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 W
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4UJ4 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 286-476
链 H
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 286-476
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；50MM MES PH 5.8, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 14% PEG 8000
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.266 |
| 4UJ4 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 286-476
链 K
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 286-476
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；50MM MES PH 5.8, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 14% PEG 8000
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.266 |
| 4UJ4 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 286-476
链 K
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 286-476
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；50MM MES PH 5.8, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 14% PEG 8000
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.266 |
| 4UJ5 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 286-476
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；0.1M HEPES PH 7.0, 0.2M LITHIUM SULFATE AND 24% PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.272 |
| 4UJ5 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
286–476（191 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 286-476
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；0.1M HEPES PH 7.0, 0.2M LITHIUM SULFATE AND 24% PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.272 |
| 6F6P Crystal structure of tetrameric human Rabin8 GEF domain 提交 2017-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
159–261（103 aa）
链 B
159–261（103 aa）
链 C
159–261（103 aa）
链 D
159–261（103 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；291 K；50 mM Tris pH 7.3 and 40% MPD
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.305 |