当前蛋白身份：Q96RK0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2M41 Solution Structure of the AXH domain of Ataxin-1 in complex with ligand peptide from Capicua 提交 2013-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
34–48（15 aa）
片段：Ataxin-1-binding linear motif (UNP 34-48)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
28–48（21 aa）
片段：UNP residues 28-48
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
28–48（21 aa）
片段：UNP residues 28-48
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
28–48（21 aa）
片段：UNP residues 28-48
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
21–48（28 aa）
片段：UNP residues 21-48
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
21–48（28 aa）
片段：UNP residues 21-48
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
199–276（78 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
199–276（78 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
199–276（78 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | Assembly 4 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 J
199–276（78 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6KZG 14-3-3 protein in Complex with CIC S301 phosphorylated peptide 提交 2019-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
298–305（8 aa）
链 Q
298–305（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；8% v/v TacsimateTM pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
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分辨率 2.00 Å R-free 0.231 |
| 6KZH 14-3-3 protein in Complex with CIC S173 phosphorylated peptide 提交 2019-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
170–177（8 aa）
链 Q
170–177（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
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分辨率 2.65 Å R-free 0.274 |
| 7M5W Crystal structure of the HMG-C1 domain of human capicua bound to DNA 提交 2021-03-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
188–280（93 aa）
片段：HMG box domain UNP residues 188-280 fused with C1 domain UNP residues 1457-1527
链 A
1457–1527（71 aa）
片段：HMG box domain UNP residues 188-280 fused with C1 domain UNP residues 1457-1527
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；100 mM MES, 100 mM CaCl2, 100 mM NaCl, and 16% (w/v) PEG 8000
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分辨率 2.95 Å R-free 0.243 |