当前蛋白身份:Q98157 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CM9 CRYSTAL STRUCTURE OF VIRAL MACROPHAGE INFLAMMATORY PROTEIN-II 提交 1999-05-19 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 21–94(74 aa)
链 B 21–94(74 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6;pH 5.6
分辨率 2.10 Å R-free 0.275
1HFF NMR solution structures of the vMIP-II 1-10 peptide from Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus. 提交 2000-12-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–33(10 aa) 片段:RESIDUES 1-10
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;281 K;离子强度(mmCIF原始值)20MM SODIUM ACETATE;压力 1
NMR样品组成 20MM SODIUM ACETATE, 1-2MM PEPTIDE, 1MM SODIUM AZIDE, 1MM DSS
分辨率未提供
1HFG NMR solution structure of vMIP-II 1-71 from Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (minimized average structure). 提交 2000-12-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–94(71 aa) 片段:RESIDUES 1-71
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;303 K;压力 1
分辨率未提供
1HFN NMR solution structures of vMIP-II 1-71 from Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus. 提交 2000-12-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–94(71 aa) 片段:RESIDUES 1-71
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;303 K;压力 1
NMR样品组成 1MM DSS, 1MM NAN3, 20MM SODIUM ACETATE
分辨率未提供
1HHV SOLUTION STRUCTURE OF VIRUS CHEMOKINE VMIP-II 提交 1998-12-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 21–94(74 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3.25;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1VMP STRUCTURE OF THE ANTI-HIV CHEMOKINE VMIP-II 提交 1999-03-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–94(71 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.01;压力 1
分辨率未提供
2FHT Crystal Structure of Viral Macrophage Inflammatory Protein-II 提交 2005-12-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–94(71 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;0.1 M sodium citrate, 11% (w/v) PEG 4000, 11%(w/v) 2-propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.331
2FJ2 Crystal Structure of Viral Macrophage Inflammatory Protein-II 提交 2005-12-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 24–94(71 aa)
链 B 24–94(71 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6;298 K;100mM Sodium Citrate, 11% PEG 4000, 11% 2-propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
分辨率 2.30 Å R-free 0.301
2FJ2 Crystal Structure of Viral Macrophage Inflammatory Protein-II 提交 2005-12-30 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 24–94(71 aa)
链 D 24–94(71 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6;298 K;100mM Sodium Citrate, 11% PEG 4000, 11% 2-propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
分辨率 2.30 Å R-free 0.301
4RWS Crystal structure of CXCR4 and viral chemokine antagonist vMIP-II complex (PSI Community Target) 提交 2014-12-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 24–94(71 aa)
突变:W5C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5.5;293 K;100 mM sodium citrate pH 5.5, 28% PEG 400, 120 mM ammonium phosphate dibasic, 2-6% polypropylene P400, Lipidic cubic phase, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.274