当前蛋白身份：Q99104
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2IX7 Structure of apo-calmodulin bound to unconventional myosin V 提交 2006-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
763–820（58 aa）
片段：RESIDUES 763-820
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CYS CYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；277 K；VAPOR DIFFUSION METHOD (4 C) PROTEIN SOLUTION; 10MG/ML IN 10MM IMIDAZOL PH7.0, 20MM NACL. RESERVOIR; 1.8M SA, 50MM MES PH5.0, 5% MPD, 5MM EGTA, 2MM NAN3, pH 5.00
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分辨率 2.50 Å R-free 0.259 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 3WB8 Crystal Structure of MyoVa-GTD 提交 2013-05-13 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；20-30%(w/v) ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 4KP3 Crystal Structure of MyoVa-GTD in Complex with Two Cargos 提交 2013-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
链 B
1469–1853（385 aa）
片段：Globular Tail Domain (GTD), UNP residues 1469-1853
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突变：C1674S 突变：C1674S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；12-16%(w/v) PEG3350, 2-4% tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.241 |
| 4ZLK Crystal structure of mouse myosin-5a in complex with calcium-bound calmodulin 提交 2015-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–791（791 aa）
片段：UNP residues 1-791
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未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Tris-HCl, pH7.5, 2 mM CaCl2, 2 mM DTT, 2 mM NaN3, 10% glycerol, 6% PEG 8000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.246 |
| 6KU0 Crystal structure of MyoVa-GTD in complex with MICAL1-GTBM 提交 2019-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1469–1853（385 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1% w/v Tryptone, 0.05M HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 6KU0 Crystal structure of MyoVa-GTD in complex with MICAL1-GTBM 提交 2019-08-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1469–1853（385 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1% w/v Tryptone, 0.05M HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 8OF8 Cryo-EM structure of actomyosin-5a-S1 with the full-length lever (nucleotide free) 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 M
1–907（907 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.50 Å |
| 8R9V CryoEM structure of the primed actomyosin-5a complex 提交 2023-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–797（797 aa）
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突变：S217A, Deletion DDEK 594-597 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；F-actin was mixed with myosin-5a (S1 1 IQ motif, residues 1-797, S217A, DDEK 594-597 deletion) that had been pre-incubated with ATP, and vitrified at 10 ms post-mixing
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分辨率 4.40 Å |
| 8RBF CryoEM structure of the post-powerstroke actomyosin-5a complex 提交 2023-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
5–767（763 aa）
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突变：S217A, Deletion DDEK 594-597 | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；F-actin was mixed with myosin-5a (S1 1 IQ motif, residues 1-797, S217A, DDEK 594-597 deletion) that had been pre-incubated with ATP, and vitrified at 120 ms post-mixing
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分辨率 4.20 Å |
| 8RBG CryoEM structure of primed myosin-5a (ADP-Pi state) 提交 2023-12-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–797（797 aa）
|
突变：S217A, Deletion DDEK 594-597 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.90 Å |