当前蛋白身份:Q99500
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7C4S Sphingosine-1-phosphate receptor 3 with a natural ligand. 提交 2020-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–378(378 aa)
|
突变:N15Q | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, 36% PEG 400, 80 mM Lithium Citrate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.263 |
| 7C4S Sphingosine-1-phosphate receptor 3 with a natural ligand. 提交 2020-05-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–378(378 aa)
|
突变:N15Q | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, 36% PEG 400, 80 mM Lithium Citrate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.263 |
| 7EW2 Cryo-EM structure of pFTY720-bound Sphingosine 1-phosphate receptor 3 in complex with Gi protein 提交 2021-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–378(378 aa)
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未记录 | J89 (2~{S})-2-azanyl-4-(4-octylphenyl)-2-[[oxidanyl-bis(oxidanylidene)-$l^{6}-phosphanyl]oxymethyl]butan-1-ol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 7EW3 Cryo-EM structure of S1P-bound Sphingosine 1-phosphate receptor 3 in complex with Gi protein 提交 2021-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–378(378 aa)
|
未记录 | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 PLM PALMITIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7EW4 Cryo-EM structure of CYM-5541-bound Sphingosine 1-phosphate receptor 3 in complex with Gi protein 提交 2021-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–378(378 aa)
|
未记录 | JF9 N,N-dicyclohexyl-5-cyclopropyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 PLM PALMITIC ACID × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9L74 Cryo-EM structure of the d16:1 S1P-bound S1PR3 and Gq complex 提交 2024-12-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
2–315(314 aa)
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未记录 | A1L69 [(~{Z},2~{R},3~{S})-2-azanyl-3-oxidanyl-hexadec-4-enyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.73 Å |
| 9W0H S1P3 in complex with cpd-32 and spm242 提交 2025-07-24 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
11–224(214 aa)
片段:H137Y, C84S, D39F, R150D
链 A
231–343(113 aa)
片段:H137Y, C84S, D39F, R150D
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 9W0L S1P3 in complex with CYM52581 and spm242 提交 2025-07-24 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
16–224(209 aa)
链 A
231–320(90 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.60 Å R-free 0.281 |
| 9W0O cryoEM structure of S1P3 in complex with heterotrimeric G protein 提交 2025-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 D
1–378(378 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 9WP9 Cryo-EM structure of the d18:1 S1P-bound S1PR3 and Gq complex 提交 2025-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
2–315(314 aa)
|
未记录 | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |