当前蛋白身份:Q99500 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7C4S Sphingosine-1-phosphate receptor 3 with a natural ligand. 提交 2020-05-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–378(378 aa)
突变:N15Q S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, 36% PEG 400, 80 mM Lithium Citrate
分辨率 3.20 Å R-free 0.263
7C4S Sphingosine-1-phosphate receptor 3 with a natural ligand. 提交 2020-05-18 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–378(378 aa)
突变:N15Q S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, 36% PEG 400, 80 mM Lithium Citrate
分辨率 3.20 Å R-free 0.263
7EW2 Cryo-EM structure of pFTY720-bound Sphingosine 1-phosphate receptor 3 in complex with Gi protein 提交 2021-05-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–378(378 aa)
未记录 J89 (2~{S})-2-azanyl-4-(4-octylphenyl)-2-[[oxidanyl-bis(oxidanylidene)-$l^{6}-phosphanyl]oxymethyl]butan-1-ol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7EW3 Cryo-EM structure of S1P-bound Sphingosine 1-phosphate receptor 3 in complex with Gi protein 提交 2021-05-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–378(378 aa)
未记录 S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 PLM PALMITIC ACID × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7EW4 Cryo-EM structure of CYM-5541-bound Sphingosine 1-phosphate receptor 3 in complex with Gi protein 提交 2021-05-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–378(378 aa)
未记录 JF9 N,N-dicyclohexyl-5-cyclopropyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 PLM PALMITIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9L74 Cryo-EM structure of the d16:1 S1P-bound S1PR3 and Gq complex 提交 2024-12-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 2–315(314 aa)
未记录 A1L69 [(~{Z},2~{R},3~{S})-2-azanyl-3-oxidanyl-hexadec-4-enyl] dihydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
9W0H S1P3 in complex with cpd-32 and spm242 提交 2025-07-24 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 11–224(214 aa) 片段:H137Y, C84S, D39F, R150D
链 A 231–343(113 aa) 片段:H137Y, C84S, D39F, R150D
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.268
9W0L S1P3 in complex with CYM52581 and spm242 提交 2025-07-24 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 16–224(209 aa)
链 A 231–320(90 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.60 Å R-free 0.281
9W0O cryoEM structure of S1P3 in complex with heterotrimeric G protein 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 1–378(378 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
9WP9 Cryo-EM structure of the d18:1 S1P-bound S1PR3 and Gq complex 提交 2025-09-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 2–315(314 aa)
未记录 S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å