当前蛋白身份：Q99728
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JM7 Solution structure of the BRCA1/BARD1 RING-domain heterodimer 提交 2001-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
26–140（115 aa）
片段：RING-Domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2M NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2M NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2M NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2M NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
sample 1: 0.8-1.1mM U-15N,13C BRCA1; unlabeled BARD1,
25mM sodium phosphate,
0.2M NaCl,
2mM DTT.
Sample 2:
0.8-1.1mM U-15N,13C BARD1; unlabeled BRCA1,
25mM sodium phosphate,
0.2M NaCl,
2mM DTT.
Sample 3:
0.8-1.1mM U-15N,13C,85%-2H BRCA1; unlabeled BARD1,
25mM sodium phosphate,
0.2M NaCl,
2mM DTT.
SAMPLE 4:
0.8-1.1mM U-15N,13C,85%-2H BARD1; unlabeled BRCA,1
25mM sodium phosphate,
0.2M NaCl,
2mM DTT. | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8-1.1mM U-15N,13C BARD1; unlabeled BRCA1
25mM sodium phosphate
0.2M NaCl
2mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8-1.1mM U-15N,13C,85%-2H BRCA1; unlabeled BARD1
25mM sodium phosphate
0.2M NaCl
2mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8-1.1mM U-15N,13C,85%-2H BARD1; unlabeled BRCA1
25mM sodium phosphate
0.2M NaCl
2mM DTT | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2NTE Crystal Structure of the BARD1 BRCT Domains 提交 2006-11-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
568–777（210 aa）
片段：BRCT domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20% PEG 8K, 150mM Ammonium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 2NTE Crystal Structure of the BARD1 BRCT Domains 提交 2006-11-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
568–777（210 aa）
片段：BRCT domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20% PEG 8K, 150mM Ammonium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 2R1Z Crystal Structure of the BARD1 BRCT Repeat 提交 2007-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
569–777（209 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；pSDDE peptide, 20% PEG 3350, 0.2 M ammonium chloride, 100 mM NaCl, 5 mM tris-HCl, 1 mM DTT, pH 7.5, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.262 |
| 2R1Z Crystal Structure of the BARD1 BRCT Repeat 提交 2007-08-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
569–777（209 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；pSDDE peptide, 20% PEG 3350, 0.2 M ammonium chloride, 100 mM NaCl, 5 mM tris-HCl, 1 mM DTT, pH 7.5, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.262 |
| 3C5R Crystal Structure of the BARD1 Ankyrin Repeat Domain and Its Functional Consequences 提交 2008-02-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
425–555（131 aa）
片段：BARD1 Ankyrin Repeat Domain (UNP residues 425-555)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 Mg Chloride, 0.1 M Tris Hydrochloride pH 8.5, 25% w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 3C5R Crystal Structure of the BARD1 Ankyrin Repeat Domain and Its Functional Consequences 提交 2008-02-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
425–555（131 aa）
片段：BARD1 Ankyrin Repeat Domain (UNP residues 425-555)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 Mg Chloride, 0.1 M Tris Hydrochloride pH 8.5, 25% w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 3C5R Crystal Structure of the BARD1 Ankyrin Repeat Domain and Its Functional Consequences 提交 2008-02-01 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
425–555（131 aa）
片段：BARD1 Ankyrin Repeat Domain (UNP residues 425-555)
链 B
425–555（131 aa）
片段：BARD1 Ankyrin Repeat Domain (UNP residues 425-555)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 Mg Chloride, 0.1 M Tris Hydrochloride pH 8.5, 25% w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 3FA2 Crystal Structure of the BRCA1 Associated Ring Domain (BARD1) Tandem BRCT Domains 提交 2008-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
566–777（212 aa）
片段：Tandem BRCT Domains
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M MES
15% w/v PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.298 |
| 3FA2 Crystal Structure of the BRCA1 Associated Ring Domain (BARD1) Tandem BRCT Domains 提交 2008-11-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
566–777（212 aa）
片段：Tandem BRCT Domains
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M MES
15% w/v PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.298 |
| 6M14 Crystal Structure of the BARD1 BRCT Mutant 提交 2020-02-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
568–777（210 aa）
|
突变：V695L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium sulfate,22% PEG 5000
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.198 |
| 6M14 Crystal Structure of the BARD1 BRCT Mutant 提交 2020-02-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
568–777（210 aa）
|
突变：V695L | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium sulfate,22% PEG 5000
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.198 |
| 7E8I Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin 提交 2021-03-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
425–777（353 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7JZV Cryo-EM structure of the BRCA1-UbcH5c/BARD1 E3-E2 module bound to a nucleosome 提交 2020-09-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 B
26–140（115 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7LYB Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with BRCA1-BARD1-UbcH5c 提交 2021-03-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 N
26–122（97 aa）
片段：RING domain (UNP residues 26-122)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 N
415–777（363 aa）
片段：Ankyrine repeat domain and the tandem BRCT domain (UNP residues 415-777)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 8GRQ Cryo-EM structure of BRCA1/BARD1 bound to H2AK127-UbcH5c-Ub nucleosome 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 M
26–117（92 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å |