当前蛋白身份：Q99741
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2CCH The crystal structure of CDK2 cyclin A in complex with a substrate peptide derived from CDC modified with a gamma-linked ATP analogue 提交 2006-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
89–100（12 aa）
片段：PEPTIDE DERIVED FROM SUBSTRATE/RECRUITMENT REGION OF CDC6 RESIDUE 89-100
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；13% PEG MONOMETHYLETHER 5000, 0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M CITRATE/ACETATE BUFFER PH 5.6 AT 4 C
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分辨率 1.70 Å R-free 0.182 |
| 2CCH The crystal structure of CDK2 cyclin A in complex with a substrate peptide derived from CDC modified with a gamma-linked ATP analogue 提交 2006-01-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
89–100（12 aa）
片段：PEPTIDE DERIVED FROM SUBSTRATE/RECRUITMENT REGION OF CDC6 RESIDUE 89-100
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；13% PEG MONOMETHYLETHER 5000, 0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M CITRATE/ACETATE BUFFER PH 5.6 AT 4 C
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.182 |
| 2CCI Crystal structure of phospho-CDK2 Cyclin A in complex with a peptide containing both the substrate and recruitment sites of CDC6 提交 2006-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
71–100（30 aa）
片段：RESIDUES 71-100
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突变：YES | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；10-17% (V/V) PEG MONOMETHYLETHER 5000, 0.2 M AMMONIUM SULPHATE AND 0.1 M MES PH 5.0-6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.321 |
| 2CCI Crystal structure of phospho-CDK2 Cyclin A in complex with a peptide containing both the substrate and recruitment sites of CDC6 提交 2006-01-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
71–100（30 aa）
片段：RESIDUES 71-100
|
突变：YES | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；10-17% (V/V) PEG MONOMETHYLETHER 5000, 0.2 M AMMONIUM SULPHATE AND 0.1 M MES PH 5.0-6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.321 |
| 4I5L Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
70–90（21 aa）
片段：UNP Q9Y5P8 residues 122-490 and UNP Q99741 residues 70-90
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未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；0.1M Na Malonate, 12% PEG 3350 + 6.2mg/mL protein in buffer Tris, 150mM NaCl , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.228 |
| 4I5L Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
70–90（21 aa）
片段：UNP Q9Y5P8 residues 122-490 and UNP Q99741 residues 70-90
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；0.1M Na Malonate, 12% PEG 3350 + 6.2mg/mL protein in buffer Tris, 150mM NaCl , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.228 |
| 4I5N Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
70–90（21 aa）
片段：UNP Q9Y5P8 residues 122-490 and UNP Q99741 residues 70-90
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.75；296 K；0.03M Succinic acid with 7% PEG 3350. Protein (6.2mg/mL) in 10mM tris pH 8.0, 150mM NaCl, 5mM DTT, 1mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.250 |
| 4I5N Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
70–90（21 aa）
片段：UNP Q9Y5P8 residues 122-490 and UNP Q99741 residues 70-90
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.75；296 K；0.03M Succinic acid with 7% PEG 3350. Protein (6.2mg/mL) in 10mM tris pH 8.0, 150mM NaCl, 5mM DTT, 1mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.250 |
| 8RWV Human OCCM DNA licensing intermediate 提交 2024-02-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–560（560 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.68 Å |
| 8S0E H. sapiens OCCM bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–560（560 aa）
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未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |