8rwv

Human OCCM DNA licensing intermediate

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 216.4 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8rwv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8rwv
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8rwv
沉积日期 deposition_date2024-02-05
最后修订 last_revision2025-02-05
结构标题 titleHuman OCCM DNA licensing intermediate
关键词 keywordsDNA Replication, MCM2-7, DNA licensing, human, origin, ORC, pre-RC, Cdc6, Cdt1, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier65.48
回转半径 Rg (电子) rg_electron65.19
零角强度 I(0) i07968280000.00
分子量 molecular_weight739910.0 kDa
排除体积 excluded_volume920380 ų
包络体积 envelope_volume1525700 ų
水化壳体积 shell_volume184950 ų
包络直径 envelope_diameter212.0
壳层 Rg shell_rg73.18
包络 Rg envelope_rg63.53
形状 Rg shape_rg65.21
总 Rg total_rg65.25
总原子数 total_atoms51862
残基数 n_residues6369
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax216.4
Rg (实空间) rg_real65.15
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.43
I(0) (实空间) i0_real7.9680e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.5930e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal65.72
I(0) (倒空间) i0_reciprocal7976000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8709
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary81.1
偏度 Skewness skewness0.198
峰度 Kurtosis kurtosis-0.526
角度范围 angular_range— – 0.1200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0008
最高正则化参数 α highest_alpha1457000000.0000
实空间数据点数 n_real_points25
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.866; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.756

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (14)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)