当前蛋白身份:Q9BXW4
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2NCN Solution Structure of the Autophagy-Related Protein LC3C 提交 2016-04-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–126(126 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6;293.15 K;离子强度(mmCIF原始值)171;压力 1
NMR样品组成
0.35-0.7 mM [U-15N] Microtubule-associated protein light chain 3C (LC3C), 20 mM PIPES, 150 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 2% [U-2H] glycerol, 90% H2O, 10% D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.35-0.7 mM [U-13C; U-15N] Microtubule-associated protein light chain 3C (LC3C), 20 mM PIPES, 150 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 2% [U-2H] glycerol, 90% H2O, 10% D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.35-0.7 mM [U-13C; U-15N] Microtubule-associated protein light chain 3C (LC3C), 20 mM PIPES, 150 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 2% [U-2H] glycerol, 100% D2O, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3VVW NDP52 in complex with LC3C 提交 2012-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–126(126 aa)
片段:UNP residues 1-126
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;16% PEG6000, 0.01M sodium citrate , pH 7.0, Vapor Diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.252 |
| 3WAM Crystal structure of human LC3C_8-125 提交 2013-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
8–125(118 aa)
片段:UNP RESIDUES 8-125
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;0.5M di-Ammonium hydrogen citrate, 10% PEG 3350, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.211 |
| 3WAM Crystal structure of human LC3C_8-125 提交 2013-05-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
8–125(118 aa)
片段:UNP RESIDUES 8-125
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;0.5M di-Ammonium hydrogen citrate, 10% PEG 3350, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.211 |
| 3WAP Crystal structure of Atg13 LIR-fused human LC3C_8-125 提交 2013-05-06 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
8–125(118 aa)
片段:UNP RESIDUES 436-447, 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;277 K;0.1M Sodium acetate trihydrate, 8% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.273 |
| 3WAP Crystal structure of Atg13 LIR-fused human LC3C_8-125 提交 2013-05-06 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
8–125(118 aa)
片段:UNP RESIDUES 436-447, 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;277 K;0.1M Sodium acetate trihydrate, 8% PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.273 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 I
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 K
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 M
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |
| 5DPW Crystal structure of PLEKHM1 LIR in complex with human LC3C_8-125 提交 2015-09-14 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 O
8–125(118 aa)
片段:UNP residues 8-125
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;0.2 M Potassium Phosphate monobasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.246 |