当前蛋白身份：Q9BZB8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2M13 The ZZ domain of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 (CPEB1) 提交 2012-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
504–566（63 aa）
片段：ZZ domain of CPEB1
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CPEB1-ZZ G-P-504, 20 mM TRIS, 200 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CPEB1-ZZ T498S, 50 mM potassium phosphate, 200 mM potassium chloride, 5 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2MKE Solution structure of CPEB1 ZZ domain in the free state 提交 2014-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
426–486（61 aa）
片段：UNP residues 426-486
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CPEB1ZZ-1, 0.4-0.6 mM [U-100% 15N] CPEB1ZZ-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2MKH Solution structure of tandem RRM domains of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 (CPEB1) in free state 提交 2014-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
219–434（216 aa）
片段：UNP residues 219-434
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成
100 mM sodium chloride-1, 1 mM DTT-2, 1 mM magnesium sulphate-3, 50 mM sodium phosphate-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2MKK Structural model of tandem RRM domains of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 (CPEB1) in complex with RNA 提交 2014-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
219–430（212 aa）
片段：UNP residues 219-430
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-80% 2H] CPEB1RRM12-1, 0.4-0.6 mM 5'-UUUUA-3'-2, 100 mM sodium chloride-3, 50 mM sodium phosphate-4, 1 mM DTT-5, 1 mM magnesium sulfate-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CPEB1RRM12-7, 0.4-0.6 mM 5'-UUUUA-3'-8, 100 mM sodium chloride-9, 50 mM sodium phosphate-10, 1 mM DTT-11, 1 mM magnesium sulfate-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CPEB1RRM12-13, 0.4-0.6 mM 5'-UUUUA-3'-14, 100 mM sodium chloride-15, 50 mM sodium phosphate-16, 1 mM DTT-17, 1 mM magnesium sulfate-18, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 15N] CPEB1RRM12-19, 0.4-0.6 mM 5'-UUUUA-3'-20, 100 mM sodium chloride-21, 50 mM sodium phosphate-22, 1 mM DTT-23, 1 mM magnesium sulfate-24, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 15N] CPEB1RRM12-25, 0.4-0.6 mM 5'-UUUUA-3'-26, 100 mM sodium chloride-27, 50 mM sodium phosphate-28, 1 mM DTT-29, 1 mM magnesium sulfate-30, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 15N] CPEB1RRM12-31, 0.4-0.6 mM 5'-CUUUA-3'-32, 100 mM sodium chloride-33, 50 mM sodium phosphate-34, 1 mM DTT-35, 1 mM magnesium sulfate-36, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4-0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CPEB1RRM12-37, 0.4-0.6 mM 5'-CUUUA-3'-38, 100 mM sodium chloride-39, 50 mM sodium phosphate-40, 1 mM DTT-41, 1 mM magnesium sulfate-42, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2N1O PIN1 WW domain in complex with a phosphorylated CPEB1 derived peptide 提交 2015-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
206–213（8 aa）
片段：UNP residues 206-213
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；285 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM Pin1, 3 mM CPEB1, 10 % [U-100% 2H] D2O, 20 mM [U-100% 2H] TRIS, 130 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |