当前蛋白身份：Q9DAG9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1WEQ Solution structure of PHD domain in PHD finger protein 7 提交 2004-05-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
232–303（72 aa）
片段：PHD domain
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.8mM U-15, 13C; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 0.1mM ZnCl2; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 8JWJ PHD Finger Protein 7 (PHF7) in complex with UBE2D2 提交 2023-06-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–307（280 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；MPD, Tris
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分辨率 2.96 Å R-free 0.222 |
| 8JWJ PHD Finger Protein 7 (PHF7) in complex with UBE2D2 提交 2023-06-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
28–307（280 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；MPD, Tris
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.222 |
| 8JWS ePHD domain of PHD Finger Protein 7 (PHF7) 提交 2023-06-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–149（122 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.7；277 K；PEG 3350, LiCl, Bicine
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分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 8JWS ePHD domain of PHD Finger Protein 7 (PHF7) 提交 2023-06-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–149（122 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.7；277 K；PEG 3350, LiCl, Bicine
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 8JWS ePHD domain of PHD Finger Protein 7 (PHF7) 提交 2023-06-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
28–149（122 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.7；277 K；PEG 3350, LiCl, Bicine
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分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 8JWU PHD Finger Protein 7 (PHF7) fused to UBE2D2 via a (GSGG)3 linker 提交 2023-06-29 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–307（280 aa）
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突变：S346R,C409K | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；PEG8000, DMSO, MOPS
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分辨率 3.58 Å R-free 0.265 |
| 8JWU PHD Finger Protein 7 (PHF7) fused to UBE2D2 via a (GSGG)3 linker 提交 2023-06-29 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–307（280 aa）
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突变：S346R,C409K | ZN ZINC ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；PEG8000, DMSO, MOPS
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分辨率 3.58 Å R-free 0.265 |
| 8JWU PHD Finger Protein 7 (PHF7) fused to UBE2D2 via a (GSGG)3 linker 提交 2023-06-29 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
28–307（280 aa）
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突变：S346R,C409K | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；PEG8000, DMSO, MOPS
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分辨率 3.58 Å R-free 0.265 |