当前蛋白身份:Q9EB06
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:complete icosahedral assembly(180) 与蛋白数一致 |
链 A
5–267(263 aa)
链 B
5–267(263 aa)
链 C
5–267(263 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 240 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
5–267(263 aa)
链 B
5–267(263 aa)
链 C
5–267(263 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
5–267(263 aa)
链 B
5–267(263 aa)
链 C
5–267(263 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
5–267(263 aa)
链 B
5–267(263 aa)
链 C
5–267(263 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
5–267(263 aa)
链 B
5–267(263 aa)
链 C
5–267(263 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
5–267(263 aa)
链 B
5–267(263 aa)
链 C
5–267(263 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 80 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:complete icosahedral assembly(60) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.214 |
| 1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.214 |
| 1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.214 |
| 1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.214 |
| 1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.214 |
| 1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.214 |
| 1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:complete icosahedral assembly(60) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
突变:D146N/D149N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.261 |
| 1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
突变:D146N/D149N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.261 |
| 1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
突变:D146N/D149N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.261 |
| 1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
突变:D146N/D149N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.261 |
| 1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
突变:D146N/D149N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.261 |
| 1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:residues 66-268
|
突变:D146N/D149N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.261 |
| 1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:complete icosahedral assembly(60) 与蛋白数一致 |
链 A
37–268(232 aa)
片段:residues 37-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.259 |
| 1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
37–268(232 aa)
片段:residues 37-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.259 |
| 1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
37–268(232 aa)
片段:residues 37-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.259 |
| 1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
37–268(232 aa)
片段:residues 37-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.259 |
| 1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
37–268(232 aa)
片段:residues 37-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.259 |
| 1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
37–268(232 aa)
片段:residues 37-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.259 |
| 1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:complete icosahedral assembly(180) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 180 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.234 |
| 1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.234 |
| 1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.234 |
| 1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.234 |
| 1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.234 |
| 1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.234 |
| 1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:complete icosahedral assembly(180) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
突变:P53A 突变:P53A 突变:P53A | CA CALCIUM ION × 180 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.270 |
| 1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
突变:P53A 突变:P53A 突变:P53A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.270 |
| 1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
突变:P53A 突变:P53A 突变:P53A | CA CALCIUM ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.270 |
| 1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
突变:P53A 突变:P53A 突变:P53A | CA CALCIUM ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.270 |
| 1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
突变:P53A 突变:P53A 突变:P53A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.270 |
| 1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 90 PDB 声明:90-meric(90) 与蛋白数一致 |
链 A
1–268(268 aa)
链 B
1–268(268 aa)
链 C
1–268(268 aa)
|
突变:P53A 突变:P53A 突变:P53A | CA CALCIUM ION × 90 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.270 |
| 1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:complete icosahedral assembly(60) 与蛋白数一致 |
链 A
32–268(237 aa)
片段:residues 32-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
32–268(237 aa)
片段:residues 32-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
32–268(237 aa)
片段:residues 32-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
32–268(237 aa)
片段:residues 32-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
32–268(237 aa)
片段:residues 32-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
32–268(237 aa)
片段:residues 32-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 180 PDB 声明:180-MERIC(180) 与蛋白数一致 |
链 A
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 A
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 180 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.258 |
| 2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 A
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.258 |
| 2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 A
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.258 |
| 2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 A
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.258 |
| 2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 A
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 B
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
1–47(47 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
链 C
60–268(209 aa)
片段:RESIDUES 1-47,60-268
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.258 |
| 2WLP Sesbania mosaic virus capsid protein dimer mutant (rCP-DEL-N65-W170K) 提交 2009-06-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:RESIDUES 66-268
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6.5;0.1 M BIS TRIS (PH 6.5) AND 28% PEG 2000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.294 |
| 2WLP Sesbania mosaic virus capsid protein dimer mutant (rCP-DEL-N65-W170K) 提交 2009-06-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
66–268(203 aa)
片段:RESIDUES 66-268
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6.5;0.1 M BIS TRIS (PH 6.5) AND 28% PEG 2000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.294 |
| 4Y4Y T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (C2 crystal form) 提交 2015-02-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 A
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 B
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 C
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 D
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 E
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 F
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 G
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 H
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 I
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 J
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 K
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 L
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 M
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 N
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 O
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 P
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Q
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 R
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 S
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 T
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 U
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 V
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 W
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 X
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Y
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Z
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 a
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 b
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 c
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 d
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-20% PEG 4000, 5% Iso-propanol, 100 mM Sodium citrate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.200 |
| 4Y5Z T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (P1 crystal form) 提交 2015-02-12 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致 |
链 0
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 1
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 2
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 3
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 4
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 5
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 6
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 7
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 A
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 B
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 C
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 D
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 E
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 F
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 G
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 H
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 I
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 J
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 K
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 L
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 M
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 N
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 O
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 P
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Q
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 R
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 S
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 T
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 U
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 V
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 W
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 X
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Y
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Z
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 a
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 b
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 c
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 d
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 e
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 f
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 g
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 h
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 i
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 j
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 k
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 l
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 m
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 n
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 o
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 p
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 q
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 r
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 s
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 t
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 u
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 v
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 w
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 x
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 y
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 z
66–268(203 aa)
片段:UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;15-25% PEG 400, 0.2M magnesium chloride, 0.1M HEPES
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.249 |