当前蛋白身份:Q9H147
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2MWI The structure of the carboxy-terminal domain of DNTTIP1 提交 2014-11-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
197–316(120 aa)
片段:carboxy-terminal domain (UNP residues 197-316)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)80;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)80;压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DNTTIP1(197-316), 40 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DNTTIP1(197-316), 40 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 1 mM sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 4D6K Structure of DNTTIP1 dimerisation domain. 提交 2014-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
56–147(92 aa)
片段:DIMERISATION DOMAIN
链 B
56–147(92 aa)
片段:DIMERISATION DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;295 K;100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6 14% PROPAN-2-OL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4D6K Structure of DNTTIP1 dimerisation domain. 提交 2014-11-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
56–147(92 aa)
片段:DIMERISATION DOMAIN
链 F
56–147(92 aa)
片段:DIMERISATION DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;295 K;100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6 14% PROPAN-2-OL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4D6K Structure of DNTTIP1 dimerisation domain. 提交 2014-11-11 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
56–147(92 aa)
片段:DIMERISATION DOMAIN
链 D
56–147(92 aa)
片段:DIMERISATION DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;295 K;100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6 14% PROPAN-2-OL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 6Z2J The structure of the dimeric HDAC1/MIDEAS/DNTTIP1 MiDAC deacetylase complex 提交 2020-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–130(130 aa)
链 B
1–130(130 aa)
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot time 3 sec, blot force 10.
|
分辨率 4.00 Å |
| 6Z2K The structure of the tetrameric HDAC1/MIDEAS/DNTTIP1 MiDAC deacetylase complex 提交 2020-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–130(130 aa)
链 B
1–130(130 aa)
链 G
1–130(130 aa)
链 H
1–130(130 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 K POTASSIUM ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot time 3 sec, blot force 10.
|
分辨率 4.50 Å |
| 9R4I An auto inhibitory loop in the MiDAC histone deacetylase complex 提交 2025-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
1–329(329 aa)
链 F
1–329(329 aa)
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未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;10 mM HEPES, 25 mM KCl, 1 micromolar Inositol Hexaphosphate
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.92 Å |