当前蛋白身份:Q9H147 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2MWI The structure of the carboxy-terminal domain of DNTTIP1 提交 2014-11-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 197–316(120 aa) 片段:carboxy-terminal domain (UNP residues 197-316)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)80;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)80;压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DNTTIP1(197-316), 40 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 1 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DNTTIP1(197-316), 40 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 1 mM sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
4D6K Structure of DNTTIP1 dimerisation domain. 提交 2014-11-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 56–147(92 aa) 片段:DIMERISATION DOMAIN
链 B 56–147(92 aa) 片段:DIMERISATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;295 K;100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6 14% PROPAN-2-OL
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4D6K Structure of DNTTIP1 dimerisation domain. 提交 2014-11-11 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 56–147(92 aa) 片段:DIMERISATION DOMAIN
链 F 56–147(92 aa) 片段:DIMERISATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;295 K;100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6 14% PROPAN-2-OL
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4D6K Structure of DNTTIP1 dimerisation domain. 提交 2014-11-11 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 56–147(92 aa) 片段:DIMERISATION DOMAIN
链 D 56–147(92 aa) 片段:DIMERISATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;295 K;100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6 14% PROPAN-2-OL
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
6Z2J The structure of the dimeric HDAC1/MIDEAS/DNTTIP1 MiDAC deacetylase complex 提交 2020-05-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–130(130 aa)
链 B 1–130(130 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot time 3 sec, blot force 10.
分辨率 4.00 Å
6Z2K The structure of the tetrameric HDAC1/MIDEAS/DNTTIP1 MiDAC deacetylase complex 提交 2020-05-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–130(130 aa)
链 B 1–130(130 aa)
链 G 1–130(130 aa)
链 H 1–130(130 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 K POTASSIUM ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot time 3 sec, blot force 10.
分辨率 4.50 Å
9R4I An auto inhibitory loop in the MiDAC histone deacetylase complex 提交 2025-05-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–329(329 aa)
链 F 1–329(329 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;10 mM HEPES, 25 mM KCl, 1 micromolar Inositol Hexaphosphate
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å