当前蛋白身份：Q9H3M7
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4GEI N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：K64A, C36S, C49S, C120S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
batch；pH 7.15；277 K；25mM Hepes, 1 mM DTT, pH 7.15, batch, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.203 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 J
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GEJ N-terminal domain of VDUP-1 提交 2012-08-02 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
2–149（148 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-149
|
突变：C36S, C49S, C120S | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 0.2 M Calcium Acetate, 10-12% PEG monomethyl ether 5000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 4GFX Crystal structure of the N-terminal domain of TXNIP 提交 2012-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–154（151 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 4-154)
|
突变：F4V,K5A,K6A | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.75 M sodium/potassium phosphate, 0.1 M HEPES sodium, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.227 |
| 4LL1 The structure of the TRX and TXNIP complex 提交 2013-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–317（315 aa）
片段：UNP residues 3-317
链 C
3–317（315 aa）
片段：UNP residues 3-317
|
突变：C120S, C170S, C205S, C267S 突变：C120S, C170S, C205S, C267S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294.15 K；0.16M tri-sodium citrate, 16% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.15K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.288 |
| 4LL4 The structure of the TRX and TXNIP complex 提交 2013-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–317（315 aa）
片段：UNP residues 3-317
链 C
3–317（315 aa）
片段：UNP residues 3-317
|
突变：C170S, C205S, C267S 突变：C170S, C205S, C267S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294.15 K；0.16M tri-sodium citrate, 16% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.15K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.264 |
| 4ROF Crystal Structure of WW3 domain of ITCH in complex with TXNIP peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
327–338（12 aa）
片段：UNP residues 327-338
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.297 |
| 4ROF Crystal Structure of WW3 domain of ITCH in complex with TXNIP peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
327–338（12 aa）
片段：UNP residues 327-338
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.297 |
| 4ROJ Crystal Structure of the VAV2 SH2 domain in complex with TXNIP phosphorylated peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
327–338（12 aa）
片段：UNP residues 327-338
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UNX UNKNOWN LIGAND × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG550-MME, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 4ROJ Crystal Structure of the VAV2 SH2 domain in complex with TXNIP phosphorylated peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
327–338（12 aa）
片段：UNP residues 327-338
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UNX UNKNOWN LIGAND × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG550-MME, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 4ROJ Crystal Structure of the VAV2 SH2 domain in complex with TXNIP phosphorylated peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
327–338（12 aa）
片段：UNP residues 327-338
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UNX UNKNOWN LIGAND × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG550-MME, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 5CQ2 Crystal Structure of tandem WW domains of ITCH in complex with TXNIP peptide 提交 2015-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
327–338（12 aa）
片段：UNP Residues 327-338
链 C
327–338（12 aa）
片段：UNP Residues 327-338
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UNX UNKNOWN LIGAND × 72 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；30% PEG4000, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.184 |
| 5DZD Crystal Structure of WW4 domain of ITCH in complex with TXNIP peptide 提交 2015-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
327–338（12 aa）
片段：UNP residues 327-338
链 D
327–338（12 aa）
片段：UNP residues 327-338
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UNX UNKNOWN LIGAND × 17 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；2 M sodium formate, 0.1 M Tris, pH 8.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.206 |