当前蛋白身份:Q9H4K7
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7O9K Human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate with MTERF4-NSUN4, MRM2, MTG1, the MALSU module, GTPBP5 and mtEF-Tu 提交 2021-04-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 67 PDB 声明:69-meric(69) 与全部聚合物一致 |
链 G
1–406(406 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 93 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7ODT State C of the human mitoribosomal large subunit assembly intermediate 提交 2021-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–406(406 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 95 PM8 S-(2-{[N-(2-HYDROXY-4-{[HYDROXY(OXIDO)PHOSPHINO]OXY}-3,3-DIMETHYLBUTANOYL)-BETA-ALANYL]AMINO}ETHYL) DECANETHIOATE × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 10 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;4 uL of the sample was blotted for 2-6 sec before plunging
|
分辨率 3.10 Å |
| 7OF5 Structure of a human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 and GTPBP5 (dataset2). 提交 2021-05-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 55 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致 |
链 x
1–406(406 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 70 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7OF7 Structure of a human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 and GTPBP5 (dataset1). 提交 2021-05-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 55 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致 |
链 x
1–406(406 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 74 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |