当前蛋白身份：Q9HBM1
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2VE7 Crystal structure of a bonsai version of the human Ndc80 complex 提交 2007-10-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
118–224（107 aa）
片段：CHIMERA OF NDC80 RESIDUES 80-286 WITH SPC25 RESIDUES 118-224
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.261 |
| 2VE7 Crystal structure of a bonsai version of the human Ndc80 complex 提交 2007-10-17 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
118–224（107 aa）
片段：CHIMERA OF NDC80 RESIDUES 80-286 WITH SPC25 RESIDUES 118-224
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.261 |
| 3IZ0 Human Ndc80 Bonsai Decorated Microtubule 提交 2010-08-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
118–224（107 aa）
链 E
118–224（107 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；80mM PIPES, 1mM MgCl2, 1mM EGTA, 1mM DTT, 0.05% Nonidet P-40, 20uM taxol
cryo-EM玻璃化条件
2ul of 0.25 mg per ml MTs applied to grid for 1 minute 4ul of 0.7 mg per ml Ndc80 bonsai added, 1 minute manually blotted, then another 4ul of Ndc80 applied 1 minute 2ul removed with pipetter Blot for 2 seconds before plunging, 0mm offset；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.60 Å |
| 8PPR Structure of the human outer kinetochore KMN network complex 提交 2023-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
1–224（224 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8Q5H Human KMN network (outer kinetochore) 提交 2023-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 5
93–224（132 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |