当前蛋白身份：Q9NP68
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1YC5 Sir2-p53 peptide-nicotinamide 提交 2004-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
372–389（18 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 NCA NICOTINAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.6；293 K；CHES, PEG3350, nicotinamide, pH 9.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.202 |
| 2FEJ Solution structure of human p53 DNA binding domain. 提交 2005-12-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
94–297（204 aa）
片段：DNA binding domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150 mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM p53 core U-15N,13C, 2H; 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.3 mM p53 core U-15N,13C, 2H + reverse ILV 13CH3 ; 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl;
90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.3 mM p53 core U-15N,13C, 2H + reverse ILV 13CH3 + reverse Tyr ; 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.3 mM p53 core U-15N,13C, 2H + Met and Phe (1H); 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.3 mM p53 core U-15N,13C, 2H + Met and Arg (1H); 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM p53 core U-15N,13C, 2H (50%); 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM p53 core N/A; 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM p53 core N/A; 25 mM Tris-HCl pH 7.1; 150 mM NaCl; 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2H1L The Structure of the Oncoprotein SV40 Large T Antigen and p53 Tumor Suppressor Complex 提交 2006-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 M
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 N
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 O
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 P
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 Q
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 R
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
|
未记录 | ZN ZINC ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；5.4% PEG 4000, 73mM Mops Buffer, 22mM Lithium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.308 |
| 2H1L The Structure of the Oncoprotein SV40 Large T Antigen and p53 Tumor Suppressor Complex 提交 2006-05-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 S
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 T
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 U
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 V
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 W
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
链 X
92–292（201 aa）
片段：DNA Binding Domain, residues 92-292
|
未记录 | ZN ZINC ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；5.4% PEG 4000, 73mM Mops Buffer, 22mM Lithium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.308 |
| 2H4F Sir2-p53 peptide-NAD+ 提交 2006-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
372–389（18 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.6；293 K；CHES, PEG3350, NAD, pH 9.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 2H4H Sir2 H116Y mutant-p53 peptide-NAD 提交 2006-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
372–389（18 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.6；293 K；CHES, PEG 3350, pH9.6, NAD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.237 |
| 2H59 Sir2 H116A-deacetylated p53 peptide-3'-o-acetyl ADP ribose 提交 2006-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
372–389（18 aa）
链 E
372–389（18 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 3OD (2S,3S,4R,5S)-2-({[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}METHYL)-4,5-DIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-3-YL ACETATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；PEG 8000, Na-Tartrate:K-Phosphate, NaCl, NAD, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |