当前蛋白身份:Q9NP91 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7Y75 SIT1-ACE2-BA.2 RBD 提交 2022-06-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–592(592 aa)
链 D 1–592(592 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7Y76 SIT1-ACE2-BA.5 RBD 提交 2022-06-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–592(592 aa)
链 D 1–592(592 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8I91 ACE2-SIT1 complex bound with proline 提交 2023-02-06 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–592(592 aa)
链 D 1–592(592 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 2 PRO PROLINE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2W Structure of human SIT1 (focussed map / refinement) 提交 2023-05-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–592(592 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;grid blotted for 3sec
分辨率 3.76 Å
8P2X Structure of human SIT1:ACE2 complex (open PD conformation) 提交 2023-05-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–592(592 aa)
链 D 1–592(592 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;grid blotted for 3sec
分辨率 3.59 Å
8P2Y Structure of human SIT1:ACE2 complex (closed PD conformation) 提交 2023-05-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–592(592 aa)
链 D 1–592(592 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;grid blotted for 3sec
分辨率 3.46 Å
8P2Z Structure of human SIT1 bound to L-pipecolate (focussed map / refinement) 提交 2023-05-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–592(592 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 YCP (2S)-piperidine-2-carboxylic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;grid blotted for 4sec after a 20sec wait time
分辨率 3.50 Å
8P30 Structure of human SIT1:ACE2 complex (open PD conformation) bound to L-pipecolate 提交 2023-05-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–592(592 aa)
链 D 1–592(592 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 YCP (2S)-piperidine-2-carboxylic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;grid blotted for 4sec after a 20sec wait time
分辨率 3.29 Å
8P31 Structure of human SIT1:ACE2 complex (closed PD conformation) bound to L-pipecolate 提交 2023-05-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–592(592 aa)
链 D 1–592(592 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 YCP (2S)-piperidine-2-carboxylic acid × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;grid blotted for 4sec after a 20sec wait time
分辨率 3.24 Å
8WM3 Cryo-EM structure of ACE2-SIT1 complex with tiagabine 提交 2023-10-02 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–592(592 aa)
链 C 1–592(592 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 TGI Tiagabine × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.34 Å