当前蛋白身份:Q9QZM2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1G5H CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACCESSORY SUBUNIT OF MURINE MITOCHONDRIAL POLYMERASE GAMMA 提交 2000-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
17–459(443 aa)
链 B
17–459(443 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;Sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.224 |
| 1G5H CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACCESSORY SUBUNIT OF MURINE MITOCHONDRIAL POLYMERASE GAMMA 提交 2000-11-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
17–459(443 aa)
链 D
17–459(443 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;Sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.224 |
| 1G5I CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACCESSORY SUBUNIT OF MURINE MITOCHONDRIAL POLYMERASE GAMMA 提交 2000-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
17–459(443 aa)
链 B
17–459(443 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;Sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 1G5I CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACCESSORY SUBUNIT OF MURINE MITOCHONDRIAL POLYMERASE GAMMA 提交 2000-11-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
17–459(443 aa)
链 D
17–459(443 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;Sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 9G74 Mouse mitochondrial DNA polymerase gamma ternary complex in replication conformer 提交 2024-07-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 B
17–459(443 aa)
链 C
17–459(443 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9G75 Mouse mitochondrial DNA polymerase gamma ternary complex in intermediate conformer 提交 2024-07-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 B
17–459(443 aa)
链 C
17–459(443 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9G77 Mouse mitochondrial DNA polymerase gamma ternary complex in error-editing conformer (composite) 提交 2024-07-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 B
17–459(443 aa)
链 C
17–459(443 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.87 Å |
| 9IC1 Chimeric mitochondrial DNA polymerase gamma ternary complex (hAmB) in replication conformer 提交 2025-02-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 B
17–459(443 aa)
链 C
17–459(443 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.73 Å |
| 9IC3 Chimeric mitochondrial DNA polymerase gamma ternary complex (hAmB) in mouse-like error-editing conformer (composite) 提交 2025-02-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 B
17–459(443 aa)
链 C
17–459(443 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |