当前蛋白身份:Q9UBL3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

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PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3RSN Crystal Structure of the N-terminal region of Human Ash2L 提交 2011-05-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 96–271(176 aa) 片段:Ash2L N-terminal domain, UNP residues 96-271
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;100 mM Tris-HCl pH8.5, 20% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.254
3S32 Crystal structure of Ash2L N-terminal domain 提交 2011-05-17 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 95–280(186 aa) 片段:N-terminal domain residues 95-280
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.2M MgAcetate and 17-20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.45 Å R-free 0.263
3TOJ Structure of the SPRY domain of human Ash2L 提交 2011-09-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 370–496(127 aa) 片段:Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617
链 A 539–617(79 aa) 片段:Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617
链 B 370–496(127 aa) 片段:Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617
链 B 539–617(79 aa) 片段:Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;20% PEG4000, 0.15 M Li2SO4, 0.1 M Tris, pH8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.07 Å R-free 0.206
4RIQ Crystal structure of DPY-30 dimerization/docking domain in complex with Ash2L Sdc1-DPY-30 Interacting region (SDI) 提交 2014-10-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 C 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
链 F 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
链 L 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
链 X 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;323 K;0.2M MgCl2, 25% PEG 3350, 0.1M Tris pH 8.5 and 10 mM spermidine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 323K
分辨率 2.23 Å R-free 0.284
4RIQ Crystal structure of DPY-30 dimerization/docking domain in complex with Ash2L Sdc1-DPY-30 Interacting region (SDI) 提交 2014-10-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 I 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
链 O 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
链 R 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
链 U 603–618(16 aa) 片段:UNP residues 603-618
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;323 K;0.2M MgCl2, 25% PEG 3350, 0.1M Tris pH 8.5 and 10 mM spermidine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 323K
分辨率 2.23 Å R-free 0.284
4X8N Crystal structure of Ash2L SPRY domain in complex with phosphorylated RbBP5 提交 2014-12-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 380–495(116 aa) 片段:UNP residues 380-495, 539-598
链 A 539–598(60 aa) 片段:UNP residues 380-495, 539-598
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;291 K;0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol
分辨率 2.10 Å R-free 0.277
4X8P Crystal structure of Ash2L SPRY domain in complex with RbBP5 提交 2014-12-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 380–495(116 aa) 片段:UNP residues 380-495, 539-598
链 A 539–598(60 aa) 片段:UNP residues 380-495, 539-598
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;291 K;0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol
分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 380–496(117 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
链 A 539–598(60 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
链 B 380–496(117 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
链 B 539–598(60 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
未记录 ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2
分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 380–496(117 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
链 A 539–598(60 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2
分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 380–496(117 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
链 B 539–598(60 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2
分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6L The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L) in complex with RbBP5 and Ash2L 提交 2015-12-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 380–496(117 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
链 B 539–598(60 aa) 片段:UNP RESIDUES 380-496, 539-598
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.9;277 K;200mM NaCl, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.213
6E2H Crystal structure of human Ash2L (SPRY domain and SDI motif) in complex with full length DPY-30 提交 2018-07-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 380–622(243 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;20mM citrate pH 4.7 and polyethylene glycol (PEG) 6000
分辨率 2.24 Å R-free 0.200
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 T 95–628(534 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 T 95–628(534 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 T 95–628(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 T 95–628(534 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 T 95–628(534 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 D 2–534(533 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 D 2–534(533 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 D 2–534(533 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 D 2–534(533 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
7BRE The crystal structure of MLL2 in complex with ASH2L and RBBP5 提交 2020-03-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 286–402(117 aa) 片段:UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504
链 A 445–504(60 aa) 片段:UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.1M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0, 12%(w/v) Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
7BRE The crystal structure of MLL2 in complex with ASH2L and RBBP5 提交 2020-03-28 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 286–402(117 aa) 片段:UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504
链 D 445–504(60 aa) 片段:UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.1M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0, 12%(w/v) Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.80 Å R-free 0.265
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 D 2–534(533 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 D 2–534(533 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.02 Å
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:heptadecameric(17) 与全部聚合物一致
链 M 95–628(534 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
7W67 The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 380–496(117 aa)
链 A 539–598(60 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.19 Å R-free 0.222
7W6A Crystal structure of the MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L complex 提交 2021-12-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 380–496(117 aa)
链 A 539–598(60 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.21 Å R-free 0.229
7W6I The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me1 peptide 提交 2021-12-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 380–496(117 aa)
链 A 539–598(60 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.56 Å R-free 0.244
7W6J The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me2 peptide 提交 2021-12-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 380–496(117 aa)
链 A 539–598(60 aa)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.68 Å R-free 0.252
7W6L The crystal structure of MLL3-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 380–496(117 aa)
链 A 539–598(60 aa)
链 B 380–496(117 aa)
链 B 539–598(60 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 10% polyethylene glycol 3350, 0.1 M MgCl2
分辨率 2.26 Å R-free 0.223
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致
链 T 1–628(628 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致
链 T 1–628(628 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致
链 T 1–628(628 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 T 1–628(628 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 T 1–628(628 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.45 Å