当前蛋白身份：Q9UBU8
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2AQL Crystal Structure of the MRG15 MRG domain 提交 2005-08-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
190–362（173 aa）
链 B
190–362（173 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；PEG 10000, cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.273 |
| 2EFI Solution structure of the chromo domain of Mortality factor 4-like protein 1 from human 提交 2007-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–93（93 aa）
片段：Chromo domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.13mM Chromo domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2F5J Crystal structure of MRG domain from human MRG15 提交 2005-11-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
190–362（173 aa）
片段：MRG domain
链 B
190–362（173 aa）
片段：MRG domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；20% PEG 4000, 0.1M HEPES, 5% iso-propanol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.243 |
| 2F5K Crystal structure of the chromo domain of human MRG15 提交 2005-11-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–90（90 aa）
片段：chromo domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；14% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.273 |
| 2F5K Crystal structure of the chromo domain of human MRG15 提交 2005-11-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–90（90 aa）
片段：chromo domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；14% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.273 |
| 2F5K Crystal structure of the chromo domain of human MRG15 提交 2005-11-26 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–90（90 aa）
片段：chromo domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；14% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.273 |
| 2F5K Crystal structure of the chromo domain of human MRG15 提交 2005-11-26 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–90（90 aa）
片段：chromo domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；14% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.273 |
| 2F5K Crystal structure of the chromo domain of human MRG15 提交 2005-11-26 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–90（90 aa）
片段：chromo domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；14% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.273 |
| 2F5K Crystal structure of the chromo domain of human MRG15 提交 2005-11-26 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–90（90 aa）
片段：chromo domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；14% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.273 |
| 2LKM Structural Basis for Molecular Interactions Involving MRG Domains: Implications in Chromatin Biology 提交 2011-10-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
194–362（169 aa）
片段：UNP residues 194-362
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突变：K201R | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K
NMR样品组成
0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 0.9 mM protein_2, 50 mM sodium phosphate, 10 % [U-100% 2H] D2O, 5 mM [U-2H] DTT, 0.2 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 0.9 mM protein_2, 50 mM potassium chloride, 100 % [U-100% 2H] D2O, 5 mM [U-2H] DTT, 0.2 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9 mM protein_1, 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 50 mM sodium phosphate, 10 % [U-100% 2H] D2O, 5 mM [U-2H] DTT, 0.2 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9 mM protein_1, 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 50 mM sodium phosphate, 100 % [U-100% 2H] D2O, 5 mM [U-2H] DTT, 0.2 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N1D Solution structure of the MRG15-MRGBP complex 提交 2015-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
194–362（169 aa）
片段：UNP residues 194-362
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein 1, 0.8 mM protein 2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein 1, 0.8 mM protein 2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9 mM protein 1, 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein 2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9 mM protein 1, 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein 2, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 6INE Crystal Structure of human ASH1L-MRG15 complex 提交 2018-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
190–362（173 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 20 % PEG 6000, 0.2 M Trimethylamine-N-oxide
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 7S4A MRG15 complex with PALB2 peptide 提交 2021-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
152–323（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；Ammonium sulfate, Tris HCl
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.297 |
| 7S4A MRG15 complex with PALB2 peptide 提交 2021-09-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
152–323（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；Ammonium sulfate, Tris HCl
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.297 |
| 8BPA Cryo-EM structure of the human SIN3B histone deacetylase complex at 3.7 Angstrom 提交 2022-11-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–362（362 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 8C60 Cryo-EM structure of the human SIN3B full-length complex at 3.4 Angstrom resolution 提交 2023-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–362（362 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |